Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx8D3YU81 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx8D3YU81 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms