Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7aB2RT54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7aB2RT54 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7aB2RT54 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms