Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slfn8B1ARD8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slfn8B1ARD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slfn8B1ARD8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slfn8B1ARD8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms