Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprsB0V2N1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprsB0V2N1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms