Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RNP2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0U1RNP2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RNP2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms