Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrit3W8DXL4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrit3W8DXL4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lrit3W8DXL4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit3W8DXL4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit3W8DXL4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrit3W8DXL4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrit3W8DXL4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrit3W8DXL4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrit3W8DXL4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrit3W8DXL4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrit3W8DXL4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrit3W8DXL4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit3W8DXL4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrit3W8DXL4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrit3W8DXL4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrit3W8DXL4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrit3W8DXL4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrit3W8DXL4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrit3W8DXL4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrit3W8DXL4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrit3W8DXL4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit3W8DXL4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrit3W8DXL4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrit3W8DXL4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrit3W8DXL4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrit3W8DXL4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrit3W8DXL4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrit3W8DXL4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrit3W8DXL4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrit3W8DXL4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrit3W8DXL4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrit3W8DXL4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrit3W8DXL4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrit3W8DXL4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrit3W8DXL4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrit3W8DXL4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrit3W8DXL4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit3W8DXL4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrit3W8DXL4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrit3W8DXL4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrit3W8DXL4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrit3W8DXL4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrit3W8DXL4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrit3W8DXL4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrit3W8DXL4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrit3W8DXL4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrit3W8DXL4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrit3W8DXL4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrit3W8DXL4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrit3W8DXL4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrit3W8DXL4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrit3W8DXL4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrit3W8DXL4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrit3W8DXL4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrit3W8DXL4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrit3W8DXL4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrit3W8DXL4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrit3W8DXL4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrit3W8DXL4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit3W8DXL4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrit3W8DXL4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrit3W8DXL4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrit3W8DXL4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrit3W8DXL4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrit3W8DXL4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrit3W8DXL4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrit3W8DXL4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrit3W8DXL4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrit3W8DXL4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrit3W8DXL4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrit3W8DXL4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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