Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN9

Rhox2d, MCG125586, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2dW4VSN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rhox2dW4VSN9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rhox2dW4VSN9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rhox2dW4VSN9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rhox2dW4VSN9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rhox2dW4VSN9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Rhox2dW4VSN9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rhox2dW4VSN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Rhox2dW4VSN9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Rhox2dW4VSN9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Rhox2dW4VSN9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Rhox2dW4VSN9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Rhox2dW4VSN9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Rhox2dW4VSN9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Rhox2dW4VSN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Rhox2dW4VSN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rhox2dW4VSN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rhox2dW4VSN9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rhox2dW4VSN9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rhox2dW4VSN9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Rhox2dW4VSN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rhox2dW4VSN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Rhox2dW4VSN9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rhox2dW4VSN9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rhox2dW4VSN9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rhox2dW4VSN9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rhox2dW4VSN9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rhox2dW4VSN9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rhox2dW4VSN9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rhox2dW4VSN9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rhox2dW4VSN9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rhox2dW4VSN9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rhox2dW4VSN9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rhox2dW4VSN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rhox2dW4VSN9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rhox2dW4VSN9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rhox2dW4VSN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rhox2dW4VSN9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Rhox2dW4VSN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rhox2dW4VSN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rhox2dW4VSN9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rhox2dW4VSN9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rhox2dW4VSN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rhox2dW4VSN9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rhox2dW4VSN9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rhox2dW4VSN9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rhox2dW4VSN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rhox2dW4VSN9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rhox2dW4VSN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Rhox2dW4VSN9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rhox2dW4VSN9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Rhox2dW4VSN9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Rhox2dW4VSN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rhox2dW4VSN9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rhox2dW4VSN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rhox2dW4VSN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rhox2dW4VSN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Rhox2dW4VSN9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rhox2dW4VSN9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rhox2dW4VSN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Rhox2dW4VSN9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rhox2dW4VSN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rhox2dW4VSN9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Rhox2dW4VSN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Rhox2dW4VSN9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Rhox2dW4VSN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,4 ms