Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rps6ka4Q9Z2B9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rps6ka4Q9Z2B9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rps6ka4Q9Z2B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Rps6ka4Q9Z2B9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rps6ka4Q9Z2B9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rps6ka4Q9Z2B9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rps6ka4Q9Z2B9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rps6ka4Q9Z2B9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rps6ka4Q9Z2B9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rps6ka4Q9Z2B9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rps6ka4Q9Z2B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rps6ka4Q9Z2B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rps6ka4Q9Z2B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Rps6ka4Q9Z2B9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rps6ka4Q9Z2B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rps6ka4Q9Z2B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rps6ka4Q9Z2B9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms