Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Rlbp1Q9Z275 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Rlbp1Q9Z275 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Rlbp1Q9Z275 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Rlbp1Q9Z275 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Rlbp1Q9Z275 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Rlbp1Q9Z275 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Rlbp1Q9Z275 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Rlbp1Q9Z275 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,42■■■■□ 3,1
Rlbp1Q9Z275 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Rlbp1Q9Z275 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Rlbp1Q9Z275 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Rlbp1Q9Z275 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Rlbp1Q9Z275 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Rlbp1Q9Z275 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Rlbp1Q9Z275 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Rlbp1Q9Z275 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Rlbp1Q9Z275 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Rlbp1Q9Z275 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Rlbp1Q9Z275 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Rlbp1Q9Z275 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Rlbp1Q9Z275 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Rlbp1Q9Z275 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Rlbp1Q9Z275 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Rlbp1Q9Z275 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Rlbp1Q9Z275 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Rlbp1Q9Z275 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Rlbp1Q9Z275 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Rlbp1Q9Z275 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Rlbp1Q9Z275 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Rlbp1Q9Z275 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Rlbp1Q9Z275 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Rlbp1Q9Z275 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Rlbp1Q9Z275 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Rlbp1Q9Z275 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Rlbp1Q9Z275 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Rlbp1Q9Z275 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Rlbp1Q9Z275 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Rlbp1Q9Z275 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Rlbp1Q9Z275 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Rlbp1Q9Z275 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Rlbp1Q9Z275 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Rlbp1Q9Z275 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33,78■■■■□ 3
Rlbp1Q9Z275 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Rlbp1Q9Z275 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Rlbp1Q9Z275 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,76■■■■□ 3
Rlbp1Q9Z275 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Rlbp1Q9Z275 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Rlbp1Q9Z275 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Rlbp1Q9Z275 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Rlbp1Q9Z275 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Rlbp1Q9Z275 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Rlbp1Q9Z275 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Rlbp1Q9Z275 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Rlbp1Q9Z275 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Rlbp1Q9Z275 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Rlbp1Q9Z275 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Rlbp1Q9Z275 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Rlbp1Q9Z275 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Rlbp1Q9Z275 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Rlbp1Q9Z275 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Rlbp1Q9Z275 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Rlbp1Q9Z275 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Rlbp1Q9Z275 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Rlbp1Q9Z275 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Rlbp1Q9Z275 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Rlbp1Q9Z275 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Rlbp1Q9Z275 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Rlbp1Q9Z275 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Rlbp1Q9Z275 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Rlbp1Q9Z275 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Rlbp1Q9Z275 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Rlbp1Q9Z275 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Rlbp1Q9Z275 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Rlbp1Q9Z275 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Rlbp1Q9Z275 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
Rlbp1Q9Z275 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Rlbp1Q9Z275 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Rlbp1Q9Z275 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Rlbp1Q9Z275 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Rlbp1Q9Z275 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Rlbp1Q9Z275 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Rlbp1Q9Z275 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Rlbp1Q9Z275 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Rlbp1Q9Z275 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Rlbp1Q9Z275 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Rlbp1Q9Z275 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms