Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cpne6Q9Z140 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne6Q9Z140 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne6Q9Z140 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cpne6Q9Z140 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cpne6Q9Z140 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpne6Q9Z140 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpne6Q9Z140 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpne6Q9Z140 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cpne6Q9Z140 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpne6Q9Z140 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cpne6Q9Z140 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpne6Q9Z140 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpne6Q9Z140 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpne6Q9Z140 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpne6Q9Z140 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpne6Q9Z140 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpne6Q9Z140 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpne6Q9Z140 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpne6Q9Z140 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne6Q9Z140 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cpne6Q9Z140 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpne6Q9Z140 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpne6Q9Z140 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cpne6Q9Z140 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpne6Q9Z140 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpne6Q9Z140 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cpne6Q9Z140 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpne6Q9Z140 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cpne6Q9Z140 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpne6Q9Z140 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpne6Q9Z140 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpne6Q9Z140 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpne6Q9Z140 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpne6Q9Z140 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpne6Q9Z140 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpne6Q9Z140 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpne6Q9Z140 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpne6Q9Z140 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cpne6Q9Z140 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpne6Q9Z140 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne6Q9Z140 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne6Q9Z140 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpne6Q9Z140 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpne6Q9Z140 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpne6Q9Z140 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpne6Q9Z140 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpne6Q9Z140 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpne6Q9Z140 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpne6Q9Z140 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpne6Q9Z140 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpne6Q9Z140 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpne6Q9Z140 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne6Q9Z140 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cpne6Q9Z140 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cpne6Q9Z140 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpne6Q9Z140 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpne6Q9Z140 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpne6Q9Z140 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne6Q9Z140 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpne6Q9Z140 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cpne6Q9Z140 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cpne6Q9Z140 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cpne6Q9Z140 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cpne6Q9Z140 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpne6Q9Z140 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpne6Q9Z140 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpne6Q9Z140 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne6Q9Z140 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne6Q9Z140 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpne6Q9Z140 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne6Q9Z140 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpne6Q9Z140 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne6Q9Z140 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne6Q9Z140 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpne6Q9Z140 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpne6Q9Z140 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne6Q9Z140 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpne6Q9Z140 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne6Q9Z140 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne6Q9Z140 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne6Q9Z140 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne6Q9Z140 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpne6Q9Z140 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms