Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,63■■■■■ 4,09
Itsn1Q9Z0R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Itsn1Q9Z0R4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40,47■■■■■ 4,07
Itsn1Q9Z0R4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Itsn1Q9Z0R4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Itsn1Q9Z0R4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Itsn1Q9Z0R4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Itsn1Q9Z0R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Itsn1Q9Z0R4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Itsn1Q9Z0R4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Itsn1Q9Z0R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Itsn1Q9Z0R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Itsn1Q9Z0R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Itsn1Q9Z0R4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,02
Itsn1Q9Z0R4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40,12■■■■■ 4,01
Itsn1Q9Z0R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40,1■■■■■ 4,01
Itsn1Q9Z0R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40,09■■■■■ 4,01
Itsn1Q9Z0R4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40,05■■■■■ 4
Itsn1Q9Z0R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Itsn1Q9Z0R4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Itsn1Q9Z0R4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Itsn1Q9Z0R4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39,9■■■■□ 3,98
Itsn1Q9Z0R4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Itsn1Q9Z0R4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,98
Itsn1Q9Z0R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Itsn1Q9Z0R4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Itsn1Q9Z0R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,85■■■■□ 3,97
Itsn1Q9Z0R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39,8■■■■□ 3,96
Itsn1Q9Z0R4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Itsn1Q9Z0R4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39,74■■■■□ 3,95
Itsn1Q9Z0R4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39,73■■■■□ 3,95
Itsn1Q9Z0R4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Itsn1Q9Z0R4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Itsn1Q9Z0R4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Itsn1Q9Z0R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Itsn1Q9Z0R4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39,68■■■■□ 3,94
Itsn1Q9Z0R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Itsn1Q9Z0R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,92
Itsn1Q9Z0R4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Itsn1Q9Z0R4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Itsn1Q9Z0R4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Itsn1Q9Z0R4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39,48■■■■□ 3,91
Itsn1Q9Z0R4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Itsn1Q9Z0R4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Itsn1Q9Z0R4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Itsn1Q9Z0R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Itsn1Q9Z0R4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Itsn1Q9Z0R4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Itsn1Q9Z0R4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Itsn1Q9Z0R4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Itsn1Q9Z0R4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Itsn1Q9Z0R4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Itsn1Q9Z0R4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Itsn1Q9Z0R4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Itsn1Q9Z0R4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Itsn1Q9Z0R4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Itsn1Q9Z0R4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Itsn1Q9Z0R4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Itsn1Q9Z0R4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Itsn1Q9Z0R4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Itsn1Q9Z0R4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Itsn1Q9Z0R4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39,17■■■■□ 3,86
Itsn1Q9Z0R4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Itsn1Q9Z0R4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Itsn1Q9Z0R4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Itsn1Q9Z0R4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Itsn1Q9Z0R4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,87■■■■□ 3,81
Itsn1Q9Z0R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Itsn1Q9Z0R4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38,85■■■■□ 3,81
Itsn1Q9Z0R4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Itsn1Q9Z0R4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,82■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38,78■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Itsn1Q9Z0R4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38,75■■■■□ 3,79
Itsn1Q9Z0R4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Itsn1Q9Z0R4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Itsn1Q9Z0R4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Itsn1Q9Z0R4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Itsn1Q9Z0R4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Itsn1Q9Z0R4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Itsn1Q9Z0R4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Itsn1Q9Z0R4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,67■■■■□ 3,78
Itsn1Q9Z0R4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Itsn1Q9Z0R4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Itsn1Q9Z0R4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38,59■■■■□ 3,77
Itsn1Q9Z0R4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Itsn1Q9Z0R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Itsn1Q9Z0R4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38,52■■■■□ 3,76
Itsn1Q9Z0R4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Itsn1Q9Z0R4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Itsn1Q9Z0R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Itsn1Q9Z0R4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Itsn1Q9Z0R4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Itsn1Q9Z0R4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Itsn1Q9Z0R4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms