Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx1Q9WV80 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx1Q9WV80 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx1Q9WV80 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx1Q9WV80 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Snx1Q9WV80 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx1Q9WV80 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx1Q9WV80 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx1Q9WV80 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx1Q9WV80 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx1Q9WV80 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx1Q9WV80 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx1Q9WV80 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx1Q9WV80 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx1Q9WV80 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx1Q9WV80 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx1Q9WV80 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx1Q9WV80 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx1Q9WV80 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx1Q9WV80 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx1Q9WV80 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snx1Q9WV80 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snx1Q9WV80 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snx1Q9WV80 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx1Q9WV80 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx1Q9WV80 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx1Q9WV80 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx1Q9WV80 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx1Q9WV80 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx1Q9WV80 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx1Q9WV80 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx1Q9WV80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snx1Q9WV80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snx1Q9WV80 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx1Q9WV80 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx1Q9WV80 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snx1Q9WV80 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx1Q9WV80 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx1Q9WV80 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx1Q9WV80 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx1Q9WV80 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx1Q9WV80 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx1Q9WV80 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx1Q9WV80 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx1Q9WV80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx1Q9WV80 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx1Q9WV80 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx1Q9WV80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx1Q9WV80 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx1Q9WV80 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snx1Q9WV80 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx1Q9WV80 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx1Q9WV80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snx1Q9WV80 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx1Q9WV80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx1Q9WV80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx1Q9WV80 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx1Q9WV80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx1Q9WV80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx1Q9WV80 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx1Q9WV80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snx1Q9WV80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx1Q9WV80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx1Q9WV80 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx1Q9WV80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx1Q9WV80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Snx1Q9WV80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms