Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ClcnkbQ9WUB6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ClcnkbQ9WUB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ClcnkbQ9WUB6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ClcnkbQ9WUB6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ClcnkbQ9WUB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ClcnkbQ9WUB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ClcnkbQ9WUB6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClcnkbQ9WUB6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ClcnkbQ9WUB6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ClcnkbQ9WUB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ClcnkbQ9WUB6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ClcnkbQ9WUB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ClcnkbQ9WUB6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ClcnkbQ9WUB6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ClcnkbQ9WUB6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ClcnkbQ9WUB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ClcnkbQ9WUB6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClcnkbQ9WUB6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClcnkbQ9WUB6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ClcnkbQ9WUB6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ClcnkbQ9WUB6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ClcnkbQ9WUB6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ClcnkbQ9WUB6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ClcnkbQ9WUB6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ClcnkbQ9WUB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ClcnkbQ9WUB6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ClcnkbQ9WUB6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ClcnkbQ9WUB6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ClcnkbQ9WUB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClcnkbQ9WUB6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClcnkbQ9WUB6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClcnkbQ9WUB6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ClcnkbQ9WUB6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ClcnkbQ9WUB6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ClcnkbQ9WUB6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ClcnkbQ9WUB6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ClcnkbQ9WUB6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ClcnkbQ9WUB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClcnkbQ9WUB6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClcnkbQ9WUB6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ClcnkbQ9WUB6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClcnkbQ9WUB6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ClcnkbQ9WUB6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ClcnkbQ9WUB6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ClcnkbQ9WUB6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ClcnkbQ9WUB6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ClcnkbQ9WUB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ClcnkbQ9WUB6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ClcnkbQ9WUB6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ClcnkbQ9WUB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ClcnkbQ9WUB6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ClcnkbQ9WUB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ClcnkbQ9WUB6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ClcnkbQ9WUB6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ClcnkbQ9WUB6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ClcnkbQ9WUB6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ClcnkbQ9WUB6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ClcnkbQ9WUB6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ClcnkbQ9WUB6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ClcnkbQ9WUB6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ClcnkbQ9WUB6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ClcnkbQ9WUB6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ClcnkbQ9WUB6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ClcnkbQ9WUB6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ClcnkbQ9WUB6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ClcnkbQ9WUB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ClcnkbQ9WUB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ClcnkbQ9WUB6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ClcnkbQ9WUB6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ClcnkbQ9WUB6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ClcnkbQ9WUB6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ClcnkbQ9WUB6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ClcnkbQ9WUB6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ClcnkbQ9WUB6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ClcnkbQ9WUB6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ClcnkbQ9WUB6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.9 ms