Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6cQ9WTM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema6cQ9WTM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6cQ9WTM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6cQ9WTM3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6cQ9WTM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema6cQ9WTM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema6cQ9WTM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema6cQ9WTM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6cQ9WTM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6cQ9WTM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema6cQ9WTM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema6cQ9WTM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6cQ9WTM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6cQ9WTM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6cQ9WTM3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6cQ9WTM3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema6cQ9WTM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema6cQ9WTM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6cQ9WTM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema6cQ9WTM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema6cQ9WTM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema6cQ9WTM3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema6cQ9WTM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sema6cQ9WTM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6cQ9WTM3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6cQ9WTM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sema6cQ9WTM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sema6cQ9WTM3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6cQ9WTM3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sema6cQ9WTM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sema6cQ9WTM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sema6cQ9WTM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sema6cQ9WTM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6cQ9WTM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema6cQ9WTM3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6cQ9WTM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6cQ9WTM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6cQ9WTM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema6cQ9WTM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema6cQ9WTM3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema6cQ9WTM3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema6cQ9WTM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6cQ9WTM3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema6cQ9WTM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6cQ9WTM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6cQ9WTM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema6cQ9WTM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema6cQ9WTM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema6cQ9WTM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema6cQ9WTM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6cQ9WTM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6cQ9WTM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6cQ9WTM3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6cQ9WTM3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6cQ9WTM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6cQ9WTM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6cQ9WTM3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6cQ9WTM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6cQ9WTM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6cQ9WTM3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema6cQ9WTM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema6cQ9WTM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema6cQ9WTM3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema6cQ9WTM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema6cQ9WTM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema6cQ9WTM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema6cQ9WTM3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6cQ9WTM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema6cQ9WTM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema6cQ9WTM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema6cQ9WTM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6cQ9WTM3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema6cQ9WTM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema6cQ9WTM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema6cQ9WTM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6cQ9WTM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema6cQ9WTM3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema6cQ9WTM3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6cQ9WTM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6cQ9WTM3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema6cQ9WTM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema6cQ9WTM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema6cQ9WTM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema6cQ9WTM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema6cQ9WTM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema6cQ9WTM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6cQ9WTM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6cQ9WTM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema6cQ9WTM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6cQ9WTM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms