Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Sema6cQ9WTM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Sema6cQ9WTM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Sema6cQ9WTM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Sema6cQ9WTM3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Sema6cQ9WTM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Sema6cQ9WTM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Sema6cQ9WTM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Sema6cQ9WTM3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Sema6cQ9WTM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Sema6cQ9WTM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Sema6cQ9WTM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Sema6cQ9WTM3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Sema6cQ9WTM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sema6cQ9WTM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sema6cQ9WTM3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sema6cQ9WTM3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Sema6cQ9WTM3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Sema6cQ9WTM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sema6cQ9WTM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Sema6cQ9WTM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sema6cQ9WTM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Sema6cQ9WTM3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Sema6cQ9WTM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Sema6cQ9WTM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Sema6cQ9WTM3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sema6cQ9WTM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Sema6cQ9WTM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Sema6cQ9WTM3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Sema6cQ9WTM3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Sema6cQ9WTM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Sema6cQ9WTM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Sema6cQ9WTM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Sema6cQ9WTM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Sema6cQ9WTM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Sema6cQ9WTM3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Sema6cQ9WTM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Sema6cQ9WTM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Sema6cQ9WTM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Sema6cQ9WTM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Sema6cQ9WTM3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Sema6cQ9WTM3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Sema6cQ9WTM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Sema6cQ9WTM3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Sema6cQ9WTM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Sema6cQ9WTM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Sema6cQ9WTM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Sema6cQ9WTM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Sema6cQ9WTM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Sema6cQ9WTM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Sema6cQ9WTM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Sema6cQ9WTM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Sema6cQ9WTM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Sema6cQ9WTM3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Sema6cQ9WTM3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Sema6cQ9WTM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Sema6cQ9WTM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Sema6cQ9WTM3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Sema6cQ9WTM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Sema6cQ9WTM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Sema6cQ9WTM3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Sema6cQ9WTM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Sema6cQ9WTM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Sema6cQ9WTM3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Sema6cQ9WTM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Sema6cQ9WTM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Sema6cQ9WTM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Sema6cQ9WTM3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Sema6cQ9WTM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Sema6cQ9WTM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Sema6cQ9WTM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Sema6cQ9WTM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Sema6cQ9WTM3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Sema6cQ9WTM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Sema6cQ9WTM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Sema6cQ9WTM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Sema6cQ9WTM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Sema6cQ9WTM3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Sema6cQ9WTM3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Sema6cQ9WTM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Sema6cQ9WTM3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Sema6cQ9WTM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Sema6cQ9WTM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Sema6cQ9WTM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Sema6cQ9WTM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Sema6cQ9WTM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Sema6cQ9WTM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Sema6cQ9WTM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Sema6cQ9WTM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Sema6cQ9WTM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Sema6cQ9WTM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms