Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Mpdu1Q9R0Q9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1,11
Mpdu1Q9R0Q9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Mpdu1Q9R0Q9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Mpdu1Q9R0Q9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Mpdu1Q9R0Q9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Mpdu1Q9R0Q9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Mpdu1Q9R0Q9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Mpdu1Q9R0Q9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Mpdu1Q9R0Q9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Mpdu1Q9R0Q9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Mpdu1Q9R0Q9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Mpdu1Q9R0Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Mpdu1Q9R0Q9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Mpdu1Q9R0Q9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Mpdu1Q9R0Q9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Mpdu1Q9R0Q9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Mpdu1Q9R0Q9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Mpdu1Q9R0Q9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Mpdu1Q9R0Q9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,64■■□□□ 1,06
Mpdu1Q9R0Q9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Mpdu1Q9R0Q9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Mpdu1Q9R0Q9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Mpdu1Q9R0Q9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Mpdu1Q9R0Q9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Mpdu1Q9R0Q9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Mpdu1Q9R0Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,29■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,28■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,28■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Mpdu1Q9R0Q9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Mpdu1Q9R0Q9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,25■□□□□ 0,99
Mpdu1Q9R0Q9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Mpdu1Q9R0Q9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Mpdu1Q9R0Q9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Mpdu1Q9R0Q9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Mpdu1Q9R0Q9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,13■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Mpdu1Q9R0Q9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Mpdu1Q9R0Q9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mpdu1Q9R0Q9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Mpdu1Q9R0Q9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Mpdu1Q9R0Q9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Mpdu1Q9R0Q9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Mpdu1Q9R0Q9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,89■□□□□ 0,93
Mpdu1Q9R0Q9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms