Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4eQ9R0Q8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4eQ9R0Q8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4eQ9R0Q8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec4eQ9R0Q8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4eQ9R0Q8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4eQ9R0Q8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4eQ9R0Q8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4eQ9R0Q8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4eQ9R0Q8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4eQ9R0Q8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4eQ9R0Q8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4eQ9R0Q8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4eQ9R0Q8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4eQ9R0Q8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4eQ9R0Q8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4eQ9R0Q8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4eQ9R0Q8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4eQ9R0Q8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4eQ9R0Q8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4eQ9R0Q8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clec4eQ9R0Q8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec4eQ9R0Q8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4eQ9R0Q8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4eQ9R0Q8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4eQ9R0Q8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4eQ9R0Q8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4eQ9R0Q8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4eQ9R0Q8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4eQ9R0Q8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec4eQ9R0Q8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4eQ9R0Q8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec4eQ9R0Q8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4eQ9R0Q8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec4eQ9R0Q8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4eQ9R0Q8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4eQ9R0Q8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec4eQ9R0Q8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4eQ9R0Q8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4eQ9R0Q8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clec4eQ9R0Q8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clec4eQ9R0Q8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clec4eQ9R0Q8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clec4eQ9R0Q8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4eQ9R0Q8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4eQ9R0Q8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4eQ9R0Q8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4eQ9R0Q8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec4eQ9R0Q8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec4eQ9R0Q8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec4eQ9R0Q8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4eQ9R0Q8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4eQ9R0Q8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4eQ9R0Q8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec4eQ9R0Q8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec4eQ9R0Q8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4eQ9R0Q8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4eQ9R0Q8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4eQ9R0Q8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4eQ9R0Q8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec4eQ9R0Q8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4eQ9R0Q8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4eQ9R0Q8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4eQ9R0Q8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec4eQ9R0Q8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4eQ9R0Q8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4eQ9R0Q8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec4eQ9R0Q8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec4eQ9R0Q8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clec4eQ9R0Q8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4eQ9R0Q8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4eQ9R0Q8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4eQ9R0Q8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4eQ9R0Q8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms