Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pcm1Q9R0L6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pcm1Q9R0L6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Pcm1Q9R0L6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Pcm1Q9R0L6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Pcm1Q9R0L6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Pcm1Q9R0L6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pcm1Q9R0L6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pcm1Q9R0L6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pcm1Q9R0L6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pcm1Q9R0L6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Pcm1Q9R0L6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Pcm1Q9R0L6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Pcm1Q9R0L6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Pcm1Q9R0L6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Pcm1Q9R0L6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Pcm1Q9R0L6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pcm1Q9R0L6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pcm1Q9R0L6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pcm1Q9R0L6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Pcm1Q9R0L6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pcm1Q9R0L6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pcm1Q9R0L6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Pcm1Q9R0L6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Pcm1Q9R0L6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Pcm1Q9R0L6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Pcm1Q9R0L6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Pcm1Q9R0L6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Pcm1Q9R0L6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Pcm1Q9R0L6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Pcm1Q9R0L6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pcm1Q9R0L6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pcm1Q9R0L6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pcm1Q9R0L6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pcm1Q9R0L6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Pcm1Q9R0L6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Pcm1Q9R0L6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Pcm1Q9R0L6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Pcm1Q9R0L6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Pcm1Q9R0L6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pcm1Q9R0L6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,05
Pcm1Q9R0L6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pcm1Q9R0L6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Pcm1Q9R0L6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Pcm1Q9R0L6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Pcm1Q9R0L6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Pcm1Q9R0L6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pcm1Q9R0L6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Pcm1Q9R0L6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcm1Q9R0L6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pcm1Q9R0L6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Pcm1Q9R0L6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Pcm1Q9R0L6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pcm1Q9R0L6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pcm1Q9R0L6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Pcm1Q9R0L6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pcm1Q9R0L6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Pcm1Q9R0L6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pcm1Q9R0L6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pcm1Q9R0L6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Pcm1Q9R0L6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pcm1Q9R0L6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pcm1Q9R0L6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Pcm1Q9R0L6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Pcm1Q9R0L6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Pcm1Q9R0L6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Pcm1Q9R0L6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Pcm1Q9R0L6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Pcm1Q9R0L6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pcm1Q9R0L6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pcm1Q9R0L6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pcm1Q9R0L6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pcm1Q9R0L6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Pcm1Q9R0L6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Pcm1Q9R0L6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Pcm1Q9R0L6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Pcm1Q9R0L6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Pcm1Q9R0L6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Pcm1Q9R0L6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Pcm1Q9R0L6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Pcm1Q9R0L6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Pcm1Q9R0L6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pcm1Q9R0L6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Pcm1Q9R0L6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Pcm1Q9R0L6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pcm1Q9R0L6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pcm1Q9R0L6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pcm1Q9R0L6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Pcm1Q9R0L6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pcm1Q9R0L6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pcm1Q9R0L6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pcm1Q9R0L6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pcm1Q9R0L6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pcm1Q9R0L6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Pcm1Q9R0L6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pcm1Q9R0L6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pcm1Q9R0L6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pcm1Q9R0L6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pcm1Q9R0L6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms