Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf4Q9QZS2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rnf4Q9QZS2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf4Q9QZS2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf4Q9QZS2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf4Q9QZS2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf4Q9QZS2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf4Q9QZS2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf4Q9QZS2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf4Q9QZS2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf4Q9QZS2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf4Q9QZS2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf4Q9QZS2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf4Q9QZS2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf4Q9QZS2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf4Q9QZS2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf4Q9QZS2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf4Q9QZS2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf4Q9QZS2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf4Q9QZS2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf4Q9QZS2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf4Q9QZS2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf4Q9QZS2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf4Q9QZS2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf4Q9QZS2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf4Q9QZS2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf4Q9QZS2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf4Q9QZS2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf4Q9QZS2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf4Q9QZS2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf4Q9QZS2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf4Q9QZS2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf4Q9QZS2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf4Q9QZS2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf4Q9QZS2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf4Q9QZS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf4Q9QZS2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf4Q9QZS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf4Q9QZS2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf4Q9QZS2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf4Q9QZS2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf4Q9QZS2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf4Q9QZS2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf4Q9QZS2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf4Q9QZS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf4Q9QZS2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rnf4Q9QZS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf4Q9QZS2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf4Q9QZS2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf4Q9QZS2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf4Q9QZS2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf4Q9QZS2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf4Q9QZS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf4Q9QZS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf4Q9QZS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf4Q9QZS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf4Q9QZS2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf4Q9QZS2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf4Q9QZS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf4Q9QZS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rnf4Q9QZS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf4Q9QZS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf4Q9QZS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf4Q9QZS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnf4Q9QZS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf4Q9QZS2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf4Q9QZS2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf4Q9QZS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf4Q9QZS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf4Q9QZS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms