Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Col4a3Q9QZS0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Col4a3Q9QZS0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Col4a3Q9QZS0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col4a3Q9QZS0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col4a3Q9QZS0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Col4a3Q9QZS0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col4a3Q9QZS0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col4a3Q9QZS0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col4a3Q9QZS0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col4a3Q9QZS0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col4a3Q9QZS0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Col4a3Q9QZS0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col4a3Q9QZS0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col4a3Q9QZS0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Col4a3Q9QZS0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Col4a3Q9QZS0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col4a3Q9QZS0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Col4a3Q9QZS0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Col4a3Q9QZS0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Col4a3Q9QZS0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Col4a3Q9QZS0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Col4a3Q9QZS0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Col4a3Q9QZS0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col4a3Q9QZS0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col4a3Q9QZS0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col4a3Q9QZS0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col4a3Q9QZS0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col4a3Q9QZS0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Col4a3Q9QZS0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Col4a3Q9QZS0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col4a3Q9QZS0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Col4a3Q9QZS0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Col4a3Q9QZS0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Col4a3Q9QZS0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Col4a3Q9QZS0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col4a3Q9QZS0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col4a3Q9QZS0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Col4a3Q9QZS0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Col4a3Q9QZS0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Col4a3Q9QZS0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Col4a3Q9QZS0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col4a3Q9QZS0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col4a3Q9QZS0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Col4a3Q9QZS0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col4a3Q9QZS0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col4a3Q9QZS0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Col4a3Q9QZS0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col4a3Q9QZS0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col4a3Q9QZS0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col4a3Q9QZS0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col4a3Q9QZS0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col4a3Q9QZS0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a3Q9QZS0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col4a3Q9QZS0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col4a3Q9QZS0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col4a3Q9QZS0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Col4a3Q9QZS0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Col4a3Q9QZS0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col4a3Q9QZS0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a3Q9QZS0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a3Q9QZS0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col4a3Q9QZS0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Col4a3Q9QZS0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col4a3Q9QZS0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col4a3Q9QZS0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a3Q9QZS0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a3Q9QZS0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a3Q9QZS0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a3Q9QZS0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col4a3Q9QZS0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col4a3Q9QZS0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col4a3Q9QZS0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a3Q9QZS0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a3Q9QZS0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col4a3Q9QZS0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms