Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nr4a3Q9QZB6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nr4a3Q9QZB6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nr4a3Q9QZB6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nr4a3Q9QZB6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr4a3Q9QZB6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nr4a3Q9QZB6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr4a3Q9QZB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nr4a3Q9QZB6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nr4a3Q9QZB6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nr4a3Q9QZB6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr4a3Q9QZB6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr4a3Q9QZB6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr4a3Q9QZB6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nr4a3Q9QZB6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr4a3Q9QZB6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nr4a3Q9QZB6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nr4a3Q9QZB6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nr4a3Q9QZB6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nr4a3Q9QZB6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nr4a3Q9QZB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr4a3Q9QZB6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nr4a3Q9QZB6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nr4a3Q9QZB6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nr4a3Q9QZB6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nr4a3Q9QZB6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nr4a3Q9QZB6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nr4a3Q9QZB6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nr4a3Q9QZB6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nr4a3Q9QZB6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nr4a3Q9QZB6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nr4a3Q9QZB6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nr4a3Q9QZB6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nr4a3Q9QZB6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nr4a3Q9QZB6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nr4a3Q9QZB6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nr4a3Q9QZB6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nr4a3Q9QZB6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nr4a3Q9QZB6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nr4a3Q9QZB6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nr4a3Q9QZB6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nr4a3Q9QZB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nr4a3Q9QZB6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nr4a3Q9QZB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nr4a3Q9QZB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nr4a3Q9QZB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nr4a3Q9QZB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nr4a3Q9QZB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nr4a3Q9QZB6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nr4a3Q9QZB6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nr4a3Q9QZB6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nr4a3Q9QZB6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nr4a3Q9QZB6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nr4a3Q9QZB6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nr4a3Q9QZB6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr4a3Q9QZB6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr4a3Q9QZB6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nr4a3Q9QZB6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nr4a3Q9QZB6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nr4a3Q9QZB6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nr4a3Q9QZB6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr4a3Q9QZB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nr4a3Q9QZB6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr4a3Q9QZB6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr4a3Q9QZB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr4a3Q9QZB6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nr4a3Q9QZB6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr4a3Q9QZB6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr4a3Q9QZB6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nr4a3Q9QZB6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nr4a3Q9QZB6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nr4a3Q9QZB6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr4a3Q9QZB6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr4a3Q9QZB6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms