Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Plxnb3Q9QY40 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Plxnb3Q9QY40 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Plxnb3Q9QY40 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Plxnb3Q9QY40 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Plxnb3Q9QY40 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Plxnb3Q9QY40 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Plxnb3Q9QY40 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Plxnb3Q9QY40 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plxnb3Q9QY40 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Plxnb3Q9QY40 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Plxnb3Q9QY40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Plxnb3Q9QY40 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Plxnb3Q9QY40 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Plxnb3Q9QY40 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Plxnb3Q9QY40 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Plxnb3Q9QY40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Plxnb3Q9QY40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Plxnb3Q9QY40 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Plxnb3Q9QY40 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Plxnb3Q9QY40 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Plxnb3Q9QY40 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Plxnb3Q9QY40 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plxnb3Q9QY40 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plxnb3Q9QY40 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Plxnb3Q9QY40 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Plxnb3Q9QY40 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Plxnb3Q9QY40 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Plxnb3Q9QY40 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Plxnb3Q9QY40 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Plxnb3Q9QY40 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Plxnb3Q9QY40 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Plxnb3Q9QY40 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Plxnb3Q9QY40 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Plxnb3Q9QY40 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Plxnb3Q9QY40 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Plxnb3Q9QY40 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Plxnb3Q9QY40 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plxnb3Q9QY40 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Plxnb3Q9QY40 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Plxnb3Q9QY40 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plxnb3Q9QY40 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Plxnb3Q9QY40 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Plxnb3Q9QY40 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Plxnb3Q9QY40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Plxnb3Q9QY40 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Plxnb3Q9QY40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Plxnb3Q9QY40 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Plxnb3Q9QY40 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Plxnb3Q9QY40 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Plxnb3Q9QY40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Plxnb3Q9QY40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Plxnb3Q9QY40 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Plxnb3Q9QY40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Plxnb3Q9QY40 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Plxnb3Q9QY40 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Plxnb3Q9QY40 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Plxnb3Q9QY40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Plxnb3Q9QY40 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Plxnb3Q9QY40 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Plxnb3Q9QY40 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Plxnb3Q9QY40 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Plxnb3Q9QY40 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Plxnb3Q9QY40 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Plxnb3Q9QY40 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Plxnb3Q9QY40 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Plxnb3Q9QY40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Plxnb3Q9QY40 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Plxnb3Q9QY40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Plxnb3Q9QY40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Plxnb3Q9QY40 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Plxnb3Q9QY40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Plxnb3Q9QY40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Plxnb3Q9QY40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Plxnb3Q9QY40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Plxnb3Q9QY40 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Plxnb3Q9QY40 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Plxnb3Q9QY40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Plxnb3Q9QY40 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Plxnb3Q9QY40 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Plxnb3Q9QY40 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Plxnb3Q9QY40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Plxnb3Q9QY40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Plxnb3Q9QY40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Plxnb3Q9QY40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Plxnb3Q9QY40 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Plxnb3Q9QY40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Plxnb3Q9QY40 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Plxnb3Q9QY40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Plxnb3Q9QY40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Plxnb3Q9QY40 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Plxnb3Q9QY40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms