Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cml5Q9QXS8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cml5Q9QXS8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cml5Q9QXS8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cml5Q9QXS8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cml5Q9QXS8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cml5Q9QXS8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cml5Q9QXS8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cml5Q9QXS8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cml5Q9QXS8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cml5Q9QXS8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cml5Q9QXS8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cml5Q9QXS8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cml5Q9QXS8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cml5Q9QXS8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cml5Q9QXS8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cml5Q9QXS8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cml5Q9QXS8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cml5Q9QXS8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cml5Q9QXS8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cml5Q9QXS8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cml5Q9QXS8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cml5Q9QXS8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cml5Q9QXS8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cml5Q9QXS8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cml5Q9QXS8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cml5Q9QXS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cml5Q9QXS8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cml5Q9QXS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cml5Q9QXS8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cml5Q9QXS8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cml5Q9QXS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cml5Q9QXS8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cml5Q9QXS8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cml5Q9QXS8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cml5Q9QXS8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cml5Q9QXS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cml5Q9QXS8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cml5Q9QXS8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cml5Q9QXS8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cml5Q9QXS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cml5Q9QXS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cml5Q9QXS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cml5Q9QXS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cml5Q9QXS8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms