Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Copg2Q9QXK3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Copg2Q9QXK3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Copg2Q9QXK3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Copg2Q9QXK3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Copg2Q9QXK3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Copg2Q9QXK3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Copg2Q9QXK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Copg2Q9QXK3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Copg2Q9QXK3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Copg2Q9QXK3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Copg2Q9QXK3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Copg2Q9QXK3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Copg2Q9QXK3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Copg2Q9QXK3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Copg2Q9QXK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Copg2Q9QXK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Copg2Q9QXK3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Copg2Q9QXK3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Copg2Q9QXK3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Copg2Q9QXK3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Copg2Q9QXK3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Copg2Q9QXK3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Copg2Q9QXK3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Copg2Q9QXK3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Copg2Q9QXK3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Copg2Q9QXK3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Copg2Q9QXK3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Copg2Q9QXK3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Copg2Q9QXK3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Copg2Q9QXK3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Copg2Q9QXK3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Copg2Q9QXK3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Copg2Q9QXK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Copg2Q9QXK3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Copg2Q9QXK3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Copg2Q9QXK3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Copg2Q9QXK3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Copg2Q9QXK3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Copg2Q9QXK3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Copg2Q9QXK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Copg2Q9QXK3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Copg2Q9QXK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Copg2Q9QXK3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Copg2Q9QXK3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Copg2Q9QXK3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Copg2Q9QXK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Copg2Q9QXK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Copg2Q9QXK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Copg2Q9QXK3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Copg2Q9QXK3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Copg2Q9QXK3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copg2Q9QXK3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Copg2Q9QXK3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Copg2Q9QXK3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copg2Q9QXK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copg2Q9QXK3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copg2Q9QXK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copg2Q9QXK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Copg2Q9QXK3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Copg2Q9QXK3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Copg2Q9QXK3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copg2Q9QXK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Copg2Q9QXK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Copg2Q9QXK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Copg2Q9QXK3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Copg2Q9QXK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Copg2Q9QXK3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Copg2Q9QXK3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Copg2Q9QXK3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Copg2Q9QXK3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Copg2Q9QXK3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Copg2Q9QXK3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Copg2Q9QXK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Copg2Q9QXK3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copg2Q9QXK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Copg2Q9QXK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Copg2Q9QXK3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Copg2Q9QXK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Copg2Q9QXK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Copg2Q9QXK3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Copg2Q9QXK3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Copg2Q9QXK3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Copg2Q9QXK3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Copg2Q9QXK3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copg2Q9QXK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copg2Q9QXK3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Copg2Q9QXK3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms