Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmub1Q9JMG3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmub1Q9JMG3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmub1Q9JMG3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmub1Q9JMG3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmub1Q9JMG3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmub1Q9JMG3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmub1Q9JMG3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmub1Q9JMG3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmub1Q9JMG3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmub1Q9JMG3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmub1Q9JMG3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmub1Q9JMG3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmub1Q9JMG3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmub1Q9JMG3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmub1Q9JMG3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmub1Q9JMG3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmub1Q9JMG3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmub1Q9JMG3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmub1Q9JMG3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmub1Q9JMG3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmub1Q9JMG3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmub1Q9JMG3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmub1Q9JMG3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmub1Q9JMG3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmub1Q9JMG3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmub1Q9JMG3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmub1Q9JMG3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmub1Q9JMG3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmub1Q9JMG3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmub1Q9JMG3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmub1Q9JMG3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmub1Q9JMG3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmub1Q9JMG3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmub1Q9JMG3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmub1Q9JMG3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmub1Q9JMG3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmub1Q9JMG3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmub1Q9JMG3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmub1Q9JMG3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmub1Q9JMG3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmub1Q9JMG3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmub1Q9JMG3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmub1Q9JMG3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmub1Q9JMG3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmub1Q9JMG3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmub1Q9JMG3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmub1Q9JMG3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmub1Q9JMG3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmub1Q9JMG3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmub1Q9JMG3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmub1Q9JMG3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmub1Q9JMG3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmub1Q9JMG3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmub1Q9JMG3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmub1Q9JMG3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmub1Q9JMG3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmub1Q9JMG3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmub1Q9JMG3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmub1Q9JMG3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmub1Q9JMG3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmub1Q9JMG3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmub1Q9JMG3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmub1Q9JMG3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmub1Q9JMG3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmub1Q9JMG3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmub1Q9JMG3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmub1Q9JMG3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmub1Q9JMG3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmub1Q9JMG3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmub1Q9JMG3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmub1Q9JMG3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmub1Q9JMG3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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