Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rabgef1Q9JM13 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rabgef1Q9JM13 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rabgef1Q9JM13 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rabgef1Q9JM13 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabgef1Q9JM13 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rabgef1Q9JM13 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rabgef1Q9JM13 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rabgef1Q9JM13 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rabgef1Q9JM13 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rabgef1Q9JM13 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rabgef1Q9JM13 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rabgef1Q9JM13 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rabgef1Q9JM13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rabgef1Q9JM13 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rabgef1Q9JM13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rabgef1Q9JM13 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rabgef1Q9JM13 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rabgef1Q9JM13 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rabgef1Q9JM13 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rabgef1Q9JM13 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rabgef1Q9JM13 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rabgef1Q9JM13 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rabgef1Q9JM13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rabgef1Q9JM13 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rabgef1Q9JM13 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabgef1Q9JM13 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rabgef1Q9JM13 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rabgef1Q9JM13 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabgef1Q9JM13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabgef1Q9JM13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rabgef1Q9JM13 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rabgef1Q9JM13 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rabgef1Q9JM13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rabgef1Q9JM13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rabgef1Q9JM13 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rabgef1Q9JM13 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rabgef1Q9JM13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rabgef1Q9JM13 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rabgef1Q9JM13 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rabgef1Q9JM13 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rabgef1Q9JM13 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rabgef1Q9JM13 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rabgef1Q9JM13 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rabgef1Q9JM13 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rabgef1Q9JM13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rabgef1Q9JM13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rabgef1Q9JM13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rabgef1Q9JM13 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rabgef1Q9JM13 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rabgef1Q9JM13 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rabgef1Q9JM13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rabgef1Q9JM13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rabgef1Q9JM13 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rabgef1Q9JM13 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rabgef1Q9JM13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rabgef1Q9JM13 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rabgef1Q9JM13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rabgef1Q9JM13 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rabgef1Q9JM13 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rabgef1Q9JM13 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rabgef1Q9JM13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rabgef1Q9JM13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rabgef1Q9JM13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabgef1Q9JM13 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rabgef1Q9JM13 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabgef1Q9JM13 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rabgef1Q9JM13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rabgef1Q9JM13 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rabgef1Q9JM13 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rabgef1Q9JM13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rabgef1Q9JM13 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rabgef1Q9JM13 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rabgef1Q9JM13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rabgef1Q9JM13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
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