Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Cd2apQ9JLQ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Cd2apQ9JLQ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cd2apQ9JLQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Cd2apQ9JLQ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Cd2apQ9JLQ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cd2apQ9JLQ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cd2apQ9JLQ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cd2apQ9JLQ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cd2apQ9JLQ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Cd2apQ9JLQ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Cd2apQ9JLQ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cd2apQ9JLQ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Cd2apQ9JLQ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Cd2apQ9JLQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Cd2apQ9JLQ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Cd2apQ9JLQ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cd2apQ9JLQ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Cd2apQ9JLQ0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Cd2apQ9JLQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Cd2apQ9JLQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cd2apQ9JLQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cd2apQ9JLQ0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Cd2apQ9JLQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Cd2apQ9JLQ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Cd2apQ9JLQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Cd2apQ9JLQ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Cd2apQ9JLQ0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Cd2apQ9JLQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Cd2apQ9JLQ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Cd2apQ9JLQ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Cd2apQ9JLQ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Cd2apQ9JLQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Cd2apQ9JLQ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Cd2apQ9JLQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Cd2apQ9JLQ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Cd2apQ9JLQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Cd2apQ9JLQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Cd2apQ9JLQ0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Cd2apQ9JLQ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Cd2apQ9JLQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cd2apQ9JLQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cd2apQ9JLQ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Cd2apQ9JLQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Cd2apQ9JLQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,92■■■□□ 2,7
Cd2apQ9JLQ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Cd2apQ9JLQ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cd2apQ9JLQ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cd2apQ9JLQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cd2apQ9JLQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Cd2apQ9JLQ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Cd2apQ9JLQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Cd2apQ9JLQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Cd2apQ9JLQ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cd2apQ9JLQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cd2apQ9JLQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Cd2apQ9JLQ0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Cd2apQ9JLQ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Cd2apQ9JLQ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Cd2apQ9JLQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Cd2apQ9JLQ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Cd2apQ9JLQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Cd2apQ9JLQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Cd2apQ9JLQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Cd2apQ9JLQ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Cd2apQ9JLQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Cd2apQ9JLQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Cd2apQ9JLQ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cd2apQ9JLQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Cd2apQ9JLQ0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Cd2apQ9JLQ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Cd2apQ9JLQ0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Cd2apQ9JLQ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Cd2apQ9JLQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Cd2apQ9JLQ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cd2apQ9JLQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cd2apQ9JLQ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Cd2apQ9JLQ0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Cd2apQ9JLQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Cd2apQ9JLQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Cd2apQ9JLQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Cd2apQ9JLQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Cd2apQ9JLQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cd2apQ9JLQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Cd2apQ9JLQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cd2apQ9JLQ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Cd2apQ9JLQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Cd2apQ9JLQ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Cd2apQ9JLQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Cd2apQ9JLQ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cd2apQ9JLQ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Cd2apQ9JLQ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cd2apQ9JLQ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cd2apQ9JLQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,57
Cd2apQ9JLQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Cd2apQ9JLQ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,9 ms