Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Stx6Q9JKK1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Stx6Q9JKK1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Stx6Q9JKK1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Stx6Q9JKK1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Stx6Q9JKK1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Stx6Q9JKK1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Stx6Q9JKK1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Stx6Q9JKK1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Stx6Q9JKK1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Stx6Q9JKK1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Stx6Q9JKK1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Stx6Q9JKK1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Stx6Q9JKK1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Stx6Q9JKK1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Stx6Q9JKK1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,78■■■□□ 2,68
Stx6Q9JKK1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Stx6Q9JKK1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Stx6Q9JKK1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Stx6Q9JKK1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Stx6Q9JKK1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Stx6Q9JKK1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Stx6Q9JKK1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Stx6Q9JKK1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Stx6Q9JKK1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Stx6Q9JKK1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Stx6Q9JKK1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Stx6Q9JKK1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Stx6Q9JKK1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Stx6Q9JKK1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Stx6Q9JKK1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Stx6Q9JKK1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Stx6Q9JKK1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Stx6Q9JKK1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Stx6Q9JKK1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Stx6Q9JKK1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Stx6Q9JKK1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Stx6Q9JKK1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,61
Stx6Q9JKK1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Stx6Q9JKK1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Stx6Q9JKK1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Stx6Q9JKK1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Stx6Q9JKK1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Stx6Q9JKK1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Stx6Q9JKK1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Stx6Q9JKK1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Stx6Q9JKK1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Stx6Q9JKK1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Stx6Q9JKK1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Stx6Q9JKK1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Stx6Q9JKK1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Stx6Q9JKK1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Stx6Q9JKK1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Stx6Q9JKK1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Stx6Q9JKK1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Stx6Q9JKK1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Stx6Q9JKK1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Stx6Q9JKK1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Stx6Q9JKK1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Stx6Q9JKK1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Stx6Q9JKK1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Stx6Q9JKK1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Stx6Q9JKK1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Stx6Q9JKK1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Stx6Q9JKK1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Stx6Q9JKK1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Stx6Q9JKK1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Stx6Q9JKK1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Stx6Q9JKK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Stx6Q9JKK1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Stx6Q9JKK1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Stx6Q9JKK1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Stx6Q9JKK1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Stx6Q9JKK1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Stx6Q9JKK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Stx6Q9JKK1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Stx6Q9JKK1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Stx6Q9JKK1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Stx6Q9JKK1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Stx6Q9JKK1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Stx6Q9JKK1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Stx6Q9JKK1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Stx6Q9JKK1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Stx6Q9JKK1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Stx6Q9JKK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Stx6Q9JKK1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Stx6Q9JKK1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Stx6Q9JKK1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Stx6Q9JKK1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,53■■■□□ 2,48
Stx6Q9JKK1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Stx6Q9JKK1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Stx6Q9JKK1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Stx6Q9JKK1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Stx6Q9JKK1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms