Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tuba8Q9JJZ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tuba8Q9JJZ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tuba8Q9JJZ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tuba8Q9JJZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tuba8Q9JJZ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tuba8Q9JJZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tuba8Q9JJZ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tuba8Q9JJZ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tuba8Q9JJZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tuba8Q9JJZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tuba8Q9JJZ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tuba8Q9JJZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tuba8Q9JJZ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tuba8Q9JJZ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tuba8Q9JJZ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tuba8Q9JJZ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tuba8Q9JJZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tuba8Q9JJZ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tuba8Q9JJZ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tuba8Q9JJZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tuba8Q9JJZ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tuba8Q9JJZ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tuba8Q9JJZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tuba8Q9JJZ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tuba8Q9JJZ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tuba8Q9JJZ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tuba8Q9JJZ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tuba8Q9JJZ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tuba8Q9JJZ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tuba8Q9JJZ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tuba8Q9JJZ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tuba8Q9JJZ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tuba8Q9JJZ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tuba8Q9JJZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tuba8Q9JJZ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tuba8Q9JJZ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tuba8Q9JJZ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tuba8Q9JJZ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tuba8Q9JJZ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tuba8Q9JJZ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tuba8Q9JJZ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tuba8Q9JJZ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tuba8Q9JJZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tuba8Q9JJZ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tuba8Q9JJZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tuba8Q9JJZ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tuba8Q9JJZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tuba8Q9JJZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tuba8Q9JJZ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tuba8Q9JJZ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tuba8Q9JJZ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tuba8Q9JJZ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tuba8Q9JJZ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tuba8Q9JJZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tuba8Q9JJZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tuba8Q9JJZ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tuba8Q9JJZ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tuba8Q9JJZ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tuba8Q9JJZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tuba8Q9JJZ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tuba8Q9JJZ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba8Q9JJZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tuba8Q9JJZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tuba8Q9JJZ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tuba8Q9JJZ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tuba8Q9JJZ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tuba8Q9JJZ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tuba8Q9JJZ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tuba8Q9JJZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tuba8Q9JJZ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tuba8Q9JJZ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms