Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tuba8Q9JJZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tuba8Q9JJZ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tuba8Q9JJZ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tuba8Q9JJZ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tuba8Q9JJZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tuba8Q9JJZ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tuba8Q9JJZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Tuba8Q9JJZ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Tuba8Q9JJZ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Tuba8Q9JJZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tuba8Q9JJZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Tuba8Q9JJZ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tuba8Q9JJZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tuba8Q9JJZ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Tuba8Q9JJZ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tuba8Q9JJZ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tuba8Q9JJZ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tuba8Q9JJZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tuba8Q9JJZ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tuba8Q9JJZ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tuba8Q9JJZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tuba8Q9JJZ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tuba8Q9JJZ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tuba8Q9JJZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tuba8Q9JJZ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Tuba8Q9JJZ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tuba8Q9JJZ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Tuba8Q9JJZ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tuba8Q9JJZ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tuba8Q9JJZ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Tuba8Q9JJZ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tuba8Q9JJZ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Tuba8Q9JJZ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Tuba8Q9JJZ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tuba8Q9JJZ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tuba8Q9JJZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tuba8Q9JJZ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tuba8Q9JJZ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tuba8Q9JJZ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tuba8Q9JJZ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tuba8Q9JJZ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Tuba8Q9JJZ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Tuba8Q9JJZ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Tuba8Q9JJZ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Tuba8Q9JJZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Tuba8Q9JJZ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Tuba8Q9JJZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Tuba8Q9JJZ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Tuba8Q9JJZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Tuba8Q9JJZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Tuba8Q9JJZ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Tuba8Q9JJZ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Tuba8Q9JJZ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Tuba8Q9JJZ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Tuba8Q9JJZ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Tuba8Q9JJZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Tuba8Q9JJZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Tuba8Q9JJZ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Tuba8Q9JJZ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Tuba8Q9JJZ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Tuba8Q9JJZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Tuba8Q9JJZ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Tuba8Q9JJZ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Tuba8Q9JJZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Tuba8Q9JJZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Tuba8Q9JJZ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Tuba8Q9JJZ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Tuba8Q9JJZ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Tuba8Q9JJZ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Tuba8Q9JJZ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Tuba8Q9JJZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Tuba8Q9JJZ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Tuba8Q9JJZ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
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