Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lmbr1Q9JIT0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lmbr1Q9JIT0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmbr1Q9JIT0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lmbr1Q9JIT0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lmbr1Q9JIT0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmbr1Q9JIT0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmbr1Q9JIT0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmbr1Q9JIT0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lmbr1Q9JIT0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmbr1Q9JIT0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lmbr1Q9JIT0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lmbr1Q9JIT0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmbr1Q9JIT0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmbr1Q9JIT0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lmbr1Q9JIT0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lmbr1Q9JIT0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lmbr1Q9JIT0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lmbr1Q9JIT0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lmbr1Q9JIT0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Lmbr1Q9JIT0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lmbr1Q9JIT0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lmbr1Q9JIT0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Lmbr1Q9JIT0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Lmbr1Q9JIT0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Lmbr1Q9JIT0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lmbr1Q9JIT0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Lmbr1Q9JIT0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lmbr1Q9JIT0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmbr1Q9JIT0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmbr1Q9JIT0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmbr1Q9JIT0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmbr1Q9JIT0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmbr1Q9JIT0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Lmbr1Q9JIT0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lmbr1Q9JIT0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Lmbr1Q9JIT0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lmbr1Q9JIT0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lmbr1Q9JIT0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Lmbr1Q9JIT0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmbr1Q9JIT0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lmbr1Q9JIT0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lmbr1Q9JIT0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmbr1Q9JIT0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmbr1Q9JIT0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmbr1Q9JIT0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmbr1Q9JIT0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmbr1Q9JIT0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmbr1Q9JIT0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmbr1Q9JIT0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmbr1Q9JIT0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lmbr1Q9JIT0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lmbr1Q9JIT0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Lmbr1Q9JIT0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmbr1Q9JIT0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lmbr1Q9JIT0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Lmbr1Q9JIT0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lmbr1Q9JIT0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lmbr1Q9JIT0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lmbr1Q9JIT0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lmbr1Q9JIT0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lmbr1Q9JIT0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lmbr1Q9JIT0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lmbr1Q9JIT0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lmbr1Q9JIT0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmbr1Q9JIT0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lmbr1Q9JIT0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Lmbr1Q9JIT0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lmbr1Q9JIT0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Lmbr1Q9JIT0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lmbr1Q9JIT0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmbr1Q9JIT0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmbr1Q9JIT0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmbr1Q9JIT0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmbr1Q9JIT0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms