Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHU2

Palmd, Palmdelphin, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalmdQ9JHU2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
PalmdQ9JHU2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
PalmdQ9JHU2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
PalmdQ9JHU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,83■■■□□ 2,53
PalmdQ9JHU2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
PalmdQ9JHU2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
PalmdQ9JHU2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
PalmdQ9JHU2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
PalmdQ9JHU2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
PalmdQ9JHU2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
PalmdQ9JHU2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
PalmdQ9JHU2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
PalmdQ9JHU2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
PalmdQ9JHU2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
PalmdQ9JHU2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
PalmdQ9JHU2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
PalmdQ9JHU2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
PalmdQ9JHU2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
PalmdQ9JHU2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
PalmdQ9JHU2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
PalmdQ9JHU2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,44■■■□□ 2,46
PalmdQ9JHU2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
PalmdQ9JHU2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
PalmdQ9JHU2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,41■■■□□ 2,46
PalmdQ9JHU2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
PalmdQ9JHU2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
PalmdQ9JHU2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
PalmdQ9JHU2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,3■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
PalmdQ9JHU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
PalmdQ9JHU2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
PalmdQ9JHU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,17■■■□□ 2,42
PalmdQ9JHU2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
PalmdQ9JHU2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
PalmdQ9JHU2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
PalmdQ9JHU2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
PalmdQ9JHU2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
PalmdQ9JHU2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
PalmdQ9JHU2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
PalmdQ9JHU2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
PalmdQ9JHU2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
PalmdQ9JHU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
PalmdQ9JHU2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
PalmdQ9JHU2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
PalmdQ9JHU2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
PalmdQ9JHU2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
PalmdQ9JHU2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
PalmdQ9JHU2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
PalmdQ9JHU2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
PalmdQ9JHU2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
PalmdQ9JHU2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
PalmdQ9JHU2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
PalmdQ9JHU2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
PalmdQ9JHU2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
PalmdQ9JHU2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
PalmdQ9JHU2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
PalmdQ9JHU2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
PalmdQ9JHU2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
PalmdQ9JHU2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
PalmdQ9JHU2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
PalmdQ9JHU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PalmdQ9JHU2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PalmdQ9JHU2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PalmdQ9JHU2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
PalmdQ9JHU2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PalmdQ9JHU2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
PalmdQ9JHU2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
PalmdQ9JHU2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
PalmdQ9JHU2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
PalmdQ9JHU2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
PalmdQ9JHU2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
PalmdQ9JHU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
PalmdQ9JHU2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PalmdQ9JHU2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
PalmdQ9JHU2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,44■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,3
PalmdQ9JHU2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
PalmdQ9JHU2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
PalmdQ9JHU2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
PalmdQ9JHU2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
PalmdQ9JHU2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
PalmdQ9JHU2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,8 ms