Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RabggtaQ9JHK4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RabggtaQ9JHK4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RabggtaQ9JHK4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RabggtaQ9JHK4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RabggtaQ9JHK4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RabggtaQ9JHK4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RabggtaQ9JHK4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RabggtaQ9JHK4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RabggtaQ9JHK4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RabggtaQ9JHK4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RabggtaQ9JHK4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RabggtaQ9JHK4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RabggtaQ9JHK4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RabggtaQ9JHK4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RabggtaQ9JHK4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RabggtaQ9JHK4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RabggtaQ9JHK4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RabggtaQ9JHK4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RabggtaQ9JHK4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RabggtaQ9JHK4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RabggtaQ9JHK4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RabggtaQ9JHK4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RabggtaQ9JHK4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RabggtaQ9JHK4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RabggtaQ9JHK4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RabggtaQ9JHK4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RabggtaQ9JHK4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RabggtaQ9JHK4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RabggtaQ9JHK4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RabggtaQ9JHK4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RabggtaQ9JHK4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RabggtaQ9JHK4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RabggtaQ9JHK4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RabggtaQ9JHK4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RabggtaQ9JHK4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RabggtaQ9JHK4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RabggtaQ9JHK4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RabggtaQ9JHK4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RabggtaQ9JHK4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RabggtaQ9JHK4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RabggtaQ9JHK4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RabggtaQ9JHK4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RabggtaQ9JHK4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RabggtaQ9JHK4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RabggtaQ9JHK4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
RabggtaQ9JHK4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RabggtaQ9JHK4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RabggtaQ9JHK4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RabggtaQ9JHK4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RabggtaQ9JHK4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RabggtaQ9JHK4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RabggtaQ9JHK4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RabggtaQ9JHK4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RabggtaQ9JHK4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RabggtaQ9JHK4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RabggtaQ9JHK4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RabggtaQ9JHK4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RabggtaQ9JHK4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RabggtaQ9JHK4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RabggtaQ9JHK4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RabggtaQ9JHK4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RabggtaQ9JHK4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
RabggtaQ9JHK4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RabggtaQ9JHK4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RabggtaQ9JHK4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RabggtaQ9JHK4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RabggtaQ9JHK4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RabggtaQ9JHK4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RabggtaQ9JHK4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RabggtaQ9JHK4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RabggtaQ9JHK4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RabggtaQ9JHK4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RabggtaQ9JHK4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RabggtaQ9JHK4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RabggtaQ9JHK4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RabggtaQ9JHK4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RabggtaQ9JHK4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RabggtaQ9JHK4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RabggtaQ9JHK4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RabggtaQ9JHK4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RabggtaQ9JHK4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RabggtaQ9JHK4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RabggtaQ9JHK4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RabggtaQ9JHK4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RabggtaQ9JHK4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
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