Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Trim39Q9ESN2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Trim39Q9ESN2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim39Q9ESN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim39Q9ESN2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Trim39Q9ESN2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Trim39Q9ESN2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Trim39Q9ESN2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Trim39Q9ESN2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Trim39Q9ESN2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trim39Q9ESN2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Trim39Q9ESN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Trim39Q9ESN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Trim39Q9ESN2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Trim39Q9ESN2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Trim39Q9ESN2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim39Q9ESN2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Trim39Q9ESN2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Trim39Q9ESN2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Trim39Q9ESN2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Trim39Q9ESN2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trim39Q9ESN2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Trim39Q9ESN2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Trim39Q9ESN2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Trim39Q9ESN2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim39Q9ESN2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Trim39Q9ESN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Trim39Q9ESN2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Trim39Q9ESN2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Trim39Q9ESN2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Trim39Q9ESN2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Trim39Q9ESN2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Trim39Q9ESN2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Trim39Q9ESN2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Trim39Q9ESN2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Trim39Q9ESN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Trim39Q9ESN2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Trim39Q9ESN2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Trim39Q9ESN2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Trim39Q9ESN2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Trim39Q9ESN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Trim39Q9ESN2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Trim39Q9ESN2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Trim39Q9ESN2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Trim39Q9ESN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Trim39Q9ESN2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Trim39Q9ESN2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Trim39Q9ESN2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Trim39Q9ESN2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
Trim39Q9ESN2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Trim39Q9ESN2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Trim39Q9ESN2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Trim39Q9ESN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Trim39Q9ESN2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Trim39Q9ESN2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Trim39Q9ESN2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Trim39Q9ESN2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Trim39Q9ESN2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Trim39Q9ESN2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Trim39Q9ESN2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Trim39Q9ESN2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Trim39Q9ESN2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Trim39Q9ESN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Trim39Q9ESN2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Trim39Q9ESN2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Trim39Q9ESN2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Trim39Q9ESN2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
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