Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.15
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.14
Rb1cc1Q9ESK9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC53.4■■■■■ 6.14
Rb1cc1Q9ESK9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.34■■■■■ 6.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC53.3■■■■■ 6.12
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.24■■■■■ 6.11
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
Rb1cc1Q9ESK9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
Rb1cc1Q9ESK9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
Rb1cc1Q9ESK9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.12■■■■■ 6.09
Rb1cc1Q9ESK9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC52.96■■■■■ 6.07
Rb1cc1Q9ESK9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC52.78■■■■■ 6.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.7■■■■■ 6.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC52.69■■■■■ 6.03
Rb1cc1Q9ESK9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC52.68■■■■■ 6.02
Rb1cc1Q9ESK9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
Rb1cc1Q9ESK9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.61■■■■■ 6.01
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC52.58■■■■■ 6.01
Rb1cc1Q9ESK9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC52.57■■■■■ 6.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
Rb1cc1Q9ESK9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
Rb1cc1Q9ESK9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.45■■■■■ 5.99
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.44■■■■■ 5.99
Rb1cc1Q9ESK9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.39■■■■■ 5.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC52.35■■■■■ 5.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC52.32■■■■■ 5.97
Rb1cc1Q9ESK9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC52.3■■■■■ 5.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.96
Rb1cc1Q9ESK9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
Rb1cc1Q9ESK9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.19■■■■■ 5.95
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC52.17■■■■■ 5.94
Rb1cc1Q9ESK9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
Rb1cc1Q9ESK9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
Rb1cc1Q9ESK9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC52.05■■■■■ 5.92
Rb1cc1Q9ESK9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC52.05■■■■■ 5.92
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.91■■■■■ 5.9
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
Rb1cc1Q9ESK9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC51.78■■■■■ 5.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC51.72■■■■■ 5.87
Rb1cc1Q9ESK9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
Rb1cc1Q9ESK9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC51.66■■■■■ 5.86
Rb1cc1Q9ESK9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.64■■■■■ 5.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
Rb1cc1Q9ESK9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.58■■■■■ 5.85
Rb1cc1Q9ESK9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC51.48■■■■■ 5.83
Rb1cc1Q9ESK9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
Rb1cc1Q9ESK9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.41■■■■■ 5.82
Rb1cc1Q9ESK9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC51.35■■■■■ 5.81
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
Rb1cc1Q9ESK9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
Rb1cc1Q9ESK9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
Rb1cc1Q9ESK9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
Rb1cc1Q9ESK9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC51.15■■■■■ 5.78
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
Rb1cc1Q9ESK9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.09■■■■■ 5.77
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
Rb1cc1Q9ESK9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
Rb1cc1Q9ESK9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC50.98■■■■■ 5.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC50.96■■■■■ 5.75
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
Rb1cc1Q9ESK9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC50.89■■■■■ 5.74
Rb1cc1Q9ESK9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
Rb1cc1Q9ESK9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
Rb1cc1Q9ESK9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
Rb1cc1Q9ESK9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
Rb1cc1Q9ESK9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC50.75■■■■■ 5.71
Rb1cc1Q9ESK9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC50.7■■■■■ 5.71
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
Rb1cc1Q9ESK9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC50.69■■■■■ 5.71
Rb1cc1Q9ESK9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.7
Rb1cc1Q9ESK9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
Rb1cc1Q9ESK9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms