Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Popdc2Q9ES82 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Popdc2Q9ES82 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,57■■■■□ 3,13
Popdc2Q9ES82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Popdc2Q9ES82 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Popdc2Q9ES82 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Popdc2Q9ES82 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Popdc2Q9ES82 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Popdc2Q9ES82 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,38■■■■□ 3,09
Popdc2Q9ES82 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Popdc2Q9ES82 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,31■■■■□ 3,08
Popdc2Q9ES82 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Popdc2Q9ES82 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Popdc2Q9ES82 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Popdc2Q9ES82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Popdc2Q9ES82 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Popdc2Q9ES82 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Popdc2Q9ES82 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Popdc2Q9ES82 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Popdc2Q9ES82 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Popdc2Q9ES82 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Popdc2Q9ES82 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34■■■■□ 3,03
Popdc2Q9ES82 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Popdc2Q9ES82 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Popdc2Q9ES82 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Popdc2Q9ES82 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Popdc2Q9ES82 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Popdc2Q9ES82 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Popdc2Q9ES82 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Popdc2Q9ES82 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Popdc2Q9ES82 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Popdc2Q9ES82 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Popdc2Q9ES82 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Popdc2Q9ES82 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Popdc2Q9ES82 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Popdc2Q9ES82 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Popdc2Q9ES82 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Popdc2Q9ES82 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,6■■■□□ 2,97
Popdc2Q9ES82 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Popdc2Q9ES82 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Popdc2Q9ES82 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Popdc2Q9ES82 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Popdc2Q9ES82 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Popdc2Q9ES82 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Popdc2Q9ES82 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Popdc2Q9ES82 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Popdc2Q9ES82 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Popdc2Q9ES82 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Popdc2Q9ES82 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Popdc2Q9ES82 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Popdc2Q9ES82 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Popdc2Q9ES82 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Popdc2Q9ES82 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Popdc2Q9ES82 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Popdc2Q9ES82 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Popdc2Q9ES82 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Popdc2Q9ES82 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Popdc2Q9ES82 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Popdc2Q9ES82 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Popdc2Q9ES82 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Popdc2Q9ES82 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Popdc2Q9ES82 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Popdc2Q9ES82 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Popdc2Q9ES82 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Popdc2Q9ES82 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Popdc2Q9ES82 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Popdc2Q9ES82 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Popdc2Q9ES82 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Popdc2Q9ES82 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Popdc2Q9ES82 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Popdc2Q9ES82 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Popdc2Q9ES82 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Popdc2Q9ES82 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,88
Popdc2Q9ES82 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Popdc2Q9ES82 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Popdc2Q9ES82 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,9■■■□□ 2,86
Popdc2Q9ES82 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,89■■■□□ 2,86
Popdc2Q9ES82 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Popdc2Q9ES82 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Popdc2Q9ES82 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Popdc2Q9ES82 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Popdc2Q9ES82 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Popdc2Q9ES82 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Popdc2Q9ES82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,73■■■□□ 2,83
Popdc2Q9ES82 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,72■■■□□ 2,83
Popdc2Q9ES82 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Popdc2Q9ES82 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Popdc2Q9ES82 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Popdc2Q9ES82 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Popdc2Q9ES82 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms