Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Popdc2Q9ES82 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Popdc2Q9ES82 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Popdc2Q9ES82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Popdc2Q9ES82 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Popdc2Q9ES82 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Popdc2Q9ES82 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Popdc2Q9ES82 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Popdc2Q9ES82 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Popdc2Q9ES82 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Popdc2Q9ES82 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Popdc2Q9ES82 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Popdc2Q9ES82 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Popdc2Q9ES82 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Popdc2Q9ES82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Popdc2Q9ES82 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Popdc2Q9ES82 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Popdc2Q9ES82 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Popdc2Q9ES82 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Popdc2Q9ES82 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Popdc2Q9ES82 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Popdc2Q9ES82 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34■■■■□ 3.03
Popdc2Q9ES82 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Popdc2Q9ES82 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Popdc2Q9ES82 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Popdc2Q9ES82 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Popdc2Q9ES82 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Popdc2Q9ES82 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Popdc2Q9ES82 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Popdc2Q9ES82 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Popdc2Q9ES82 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Popdc2Q9ES82 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Popdc2Q9ES82 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Popdc2Q9ES82 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Popdc2Q9ES82 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Popdc2Q9ES82 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Popdc2Q9ES82 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Popdc2Q9ES82 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Popdc2Q9ES82 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Popdc2Q9ES82 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Popdc2Q9ES82 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Popdc2Q9ES82 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Popdc2Q9ES82 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Popdc2Q9ES82 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Popdc2Q9ES82 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Popdc2Q9ES82 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Popdc2Q9ES82 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Popdc2Q9ES82 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Popdc2Q9ES82 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Popdc2Q9ES82 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Popdc2Q9ES82 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Popdc2Q9ES82 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Popdc2Q9ES82 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Popdc2Q9ES82 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Popdc2Q9ES82 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Popdc2Q9ES82 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Popdc2Q9ES82 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Popdc2Q9ES82 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Popdc2Q9ES82 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Popdc2Q9ES82 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Popdc2Q9ES82 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Popdc2Q9ES82 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Popdc2Q9ES82 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Popdc2Q9ES82 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Popdc2Q9ES82 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Popdc2Q9ES82 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Popdc2Q9ES82 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Popdc2Q9ES82 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Popdc2Q9ES82 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Popdc2Q9ES82 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Popdc2Q9ES82 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Popdc2Q9ES82 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Popdc2Q9ES82 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Popdc2Q9ES82 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Popdc2Q9ES82 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Popdc2Q9ES82 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Popdc2Q9ES82 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Popdc2Q9ES82 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Popdc2Q9ES82 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Popdc2Q9ES82 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Popdc2Q9ES82 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Popdc2Q9ES82 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Popdc2Q9ES82 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Popdc2Q9ES82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Popdc2Q9ES82 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Popdc2Q9ES82 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Popdc2Q9ES82 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Popdc2Q9ES82 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Popdc2Q9ES82 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Popdc2Q9ES82 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms