Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndel1Q9ERR1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndel1Q9ERR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndel1Q9ERR1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndel1Q9ERR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndel1Q9ERR1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndel1Q9ERR1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndel1Q9ERR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndel1Q9ERR1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndel1Q9ERR1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndel1Q9ERR1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ndel1Q9ERR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndel1Q9ERR1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndel1Q9ERR1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndel1Q9ERR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndel1Q9ERR1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndel1Q9ERR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndel1Q9ERR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndel1Q9ERR1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndel1Q9ERR1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndel1Q9ERR1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndel1Q9ERR1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndel1Q9ERR1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndel1Q9ERR1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndel1Q9ERR1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndel1Q9ERR1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndel1Q9ERR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndel1Q9ERR1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndel1Q9ERR1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndel1Q9ERR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndel1Q9ERR1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndel1Q9ERR1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndel1Q9ERR1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndel1Q9ERR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndel1Q9ERR1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndel1Q9ERR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndel1Q9ERR1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ndel1Q9ERR1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndel1Q9ERR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndel1Q9ERR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndel1Q9ERR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndel1Q9ERR1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndel1Q9ERR1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndel1Q9ERR1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndel1Q9ERR1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndel1Q9ERR1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndel1Q9ERR1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndel1Q9ERR1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndel1Q9ERR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndel1Q9ERR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndel1Q9ERR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndel1Q9ERR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndel1Q9ERR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndel1Q9ERR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndel1Q9ERR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndel1Q9ERR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndel1Q9ERR1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndel1Q9ERR1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndel1Q9ERR1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms