Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tor1bQ9ER41 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tor1bQ9ER41 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Tor1bQ9ER41 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tor1bQ9ER41 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tor1bQ9ER41 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tor1bQ9ER41 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tor1bQ9ER41 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tor1bQ9ER41 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tor1bQ9ER41 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tor1bQ9ER41 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tor1bQ9ER41 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tor1bQ9ER41 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tor1bQ9ER41 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tor1bQ9ER41 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tor1bQ9ER41 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tor1bQ9ER41 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tor1bQ9ER41 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tor1bQ9ER41 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tor1bQ9ER41 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tor1bQ9ER41 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tor1bQ9ER41 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tor1bQ9ER41 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tor1bQ9ER41 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tor1bQ9ER41 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tor1bQ9ER41 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tor1bQ9ER41 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tor1bQ9ER41 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tor1bQ9ER41 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tor1bQ9ER41 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tor1bQ9ER41 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tor1bQ9ER41 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tor1bQ9ER41 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tor1bQ9ER41 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tor1bQ9ER41 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tor1bQ9ER41 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tor1bQ9ER41 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tor1bQ9ER41 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tor1bQ9ER41 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor1bQ9ER41 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tor1bQ9ER41 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tor1bQ9ER41 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tor1bQ9ER41 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tor1bQ9ER41 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tor1bQ9ER41 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tor1bQ9ER41 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tor1bQ9ER41 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tor1bQ9ER41 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tor1bQ9ER41 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tor1bQ9ER41 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tor1bQ9ER41 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tor1bQ9ER41 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tor1bQ9ER41 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tor1bQ9ER41 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tor1bQ9ER41 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tor1bQ9ER41 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tor1bQ9ER41 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tor1bQ9ER41 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tor1bQ9ER41 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tor1bQ9ER41 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tor1bQ9ER41 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tor1bQ9ER41 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tor1bQ9ER41 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tor1bQ9ER41 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tor1bQ9ER41 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tor1bQ9ER41 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tor1bQ9ER41 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tor1bQ9ER41 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tor1bQ9ER41 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tor1bQ9ER41 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tor1bQ9ER41 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tor1bQ9ER41 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tor1bQ9ER41 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tor1bQ9ER41 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tor1bQ9ER41 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tor1bQ9ER41 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tor1bQ9ER41 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tor1bQ9ER41 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tor1bQ9ER41 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tor1bQ9ER41 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tor1bQ9ER41 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tor1bQ9ER41 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tor1bQ9ER41 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tor1bQ9ER41 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tor1bQ9ER41 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tor1bQ9ER41 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms