Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ndufs3Q9DCT2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ndufs3Q9DCT2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ndufs3Q9DCT2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ndufs3Q9DCT2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ndufs3Q9DCT2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ndufs3Q9DCT2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ndufs3Q9DCT2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ndufs3Q9DCT2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ndufs3Q9DCT2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ndufs3Q9DCT2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ndufs3Q9DCT2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ndufs3Q9DCT2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ndufs3Q9DCT2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ndufs3Q9DCT2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ndufs3Q9DCT2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ndufs3Q9DCT2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ndufs3Q9DCT2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ndufs3Q9DCT2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ndufs3Q9DCT2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ndufs3Q9DCT2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ndufs3Q9DCT2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ndufs3Q9DCT2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ndufs3Q9DCT2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ndufs3Q9DCT2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndufs3Q9DCT2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufs3Q9DCT2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufs3Q9DCT2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ndufs3Q9DCT2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufs3Q9DCT2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ndufs3Q9DCT2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ndufs3Q9DCT2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufs3Q9DCT2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufs3Q9DCT2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufs3Q9DCT2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufs3Q9DCT2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufs3Q9DCT2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufs3Q9DCT2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ndufs3Q9DCT2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ndufs3Q9DCT2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufs3Q9DCT2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufs3Q9DCT2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufs3Q9DCT2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufs3Q9DCT2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufs3Q9DCT2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufs3Q9DCT2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufs3Q9DCT2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufs3Q9DCT2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufs3Q9DCT2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufs3Q9DCT2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufs3Q9DCT2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufs3Q9DCT2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufs3Q9DCT2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufs3Q9DCT2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufs3Q9DCT2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufs3Q9DCT2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufs3Q9DCT2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufs3Q9DCT2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufs3Q9DCT2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndufs3Q9DCT2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufs3Q9DCT2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ndufs3Q9DCT2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufs3Q9DCT2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ndufs3Q9DCT2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ndufs3Q9DCT2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ndufs3Q9DCT2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufs3Q9DCT2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufs3Q9DCT2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ndufs3Q9DCT2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ndufs3Q9DCT2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndufs3Q9DCT2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndufs3Q9DCT2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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