Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Eif3fQ9DCH4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3fQ9DCH4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Eif3fQ9DCH4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eif3fQ9DCH4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eif3fQ9DCH4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eif3fQ9DCH4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eif3fQ9DCH4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Eif3fQ9DCH4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eif3fQ9DCH4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Eif3fQ9DCH4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eif3fQ9DCH4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3fQ9DCH4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3fQ9DCH4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eif3fQ9DCH4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eif3fQ9DCH4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3fQ9DCH4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3fQ9DCH4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3fQ9DCH4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Eif3fQ9DCH4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Eif3fQ9DCH4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Eif3fQ9DCH4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Eif3fQ9DCH4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Eif3fQ9DCH4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eif3fQ9DCH4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3fQ9DCH4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3fQ9DCH4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3fQ9DCH4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3fQ9DCH4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3fQ9DCH4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3fQ9DCH4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3fQ9DCH4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3fQ9DCH4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3fQ9DCH4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3fQ9DCH4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3fQ9DCH4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eif3fQ9DCH4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eif3fQ9DCH4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif3fQ9DCH4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif3fQ9DCH4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif3fQ9DCH4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif3fQ9DCH4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3fQ9DCH4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif3fQ9DCH4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3fQ9DCH4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif3fQ9DCH4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3fQ9DCH4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3fQ9DCH4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3fQ9DCH4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3fQ9DCH4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3fQ9DCH4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif3fQ9DCH4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3fQ9DCH4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms