Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cpne8Q9DC53 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpne8Q9DC53 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cpne8Q9DC53 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cpne8Q9DC53 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cpne8Q9DC53 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cpne8Q9DC53 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cpne8Q9DC53 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cpne8Q9DC53 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cpne8Q9DC53 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cpne8Q9DC53 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cpne8Q9DC53 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cpne8Q9DC53 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpne8Q9DC53 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cpne8Q9DC53 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cpne8Q9DC53 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cpne8Q9DC53 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpne8Q9DC53 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cpne8Q9DC53 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpne8Q9DC53 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cpne8Q9DC53 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpne8Q9DC53 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cpne8Q9DC53 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cpne8Q9DC53 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpne8Q9DC53 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cpne8Q9DC53 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cpne8Q9DC53 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cpne8Q9DC53 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cpne8Q9DC53 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpne8Q9DC53 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpne8Q9DC53 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cpne8Q9DC53 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cpne8Q9DC53 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cpne8Q9DC53 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cpne8Q9DC53 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cpne8Q9DC53 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cpne8Q9DC53 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpne8Q9DC53 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpne8Q9DC53 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cpne8Q9DC53 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpne8Q9DC53 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cpne8Q9DC53 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cpne8Q9DC53 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cpne8Q9DC53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cpne8Q9DC53 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpne8Q9DC53 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cpne8Q9DC53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cpne8Q9DC53 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpne8Q9DC53 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpne8Q9DC53 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cpne8Q9DC53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cpne8Q9DC53 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cpne8Q9DC53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpne8Q9DC53 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cpne8Q9DC53 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpne8Q9DC53 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cpne8Q9DC53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpne8Q9DC53 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpne8Q9DC53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpne8Q9DC53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cpne8Q9DC53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cpne8Q9DC53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpne8Q9DC53 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpne8Q9DC53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpne8Q9DC53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpne8Q9DC53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cpne8Q9DC53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpne8Q9DC53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cpne8Q9DC53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cpne8Q9DC53 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cpne8Q9DC53 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cpne8Q9DC53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cpne8Q9DC53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cpne8Q9DC53 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cpne8Q9DC53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cpne8Q9DC53 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cpne8Q9DC53 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cpne8Q9DC53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpne8Q9DC53 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cpne8Q9DC53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cpne8Q9DC53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cpne8Q9DC53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cpne8Q9DC53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cpne8Q9DC53 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cpne8Q9DC53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cpne8Q9DC53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cpne8Q9DC53 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cpne8Q9DC53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cpne8Q9DC53 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms