Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
CrotQ9DC50 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
CrotQ9DC50 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
CrotQ9DC50 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
CrotQ9DC50 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
CrotQ9DC50 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
CrotQ9DC50 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
CrotQ9DC50 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
CrotQ9DC50 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
CrotQ9DC50 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
CrotQ9DC50 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,4■■□□□ 1,98
CrotQ9DC50 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,38■■□□□ 1,97
CrotQ9DC50 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
CrotQ9DC50 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
CrotQ9DC50 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
CrotQ9DC50 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
CrotQ9DC50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CrotQ9DC50 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
CrotQ9DC50 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
CrotQ9DC50 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
CrotQ9DC50 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
CrotQ9DC50 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
CrotQ9DC50 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
CrotQ9DC50 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
CrotQ9DC50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
CrotQ9DC50 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
CrotQ9DC50 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
CrotQ9DC50 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
CrotQ9DC50 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
CrotQ9DC50 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
CrotQ9DC50 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
CrotQ9DC50 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
CrotQ9DC50 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
CrotQ9DC50 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
CrotQ9DC50 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
CrotQ9DC50 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
CrotQ9DC50 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
CrotQ9DC50 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
CrotQ9DC50 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
CrotQ9DC50 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,91■■□□□ 1,9
CrotQ9DC50 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
CrotQ9DC50 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
CrotQ9DC50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,86■■□□□ 1,89
CrotQ9DC50 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
CrotQ9DC50 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
CrotQ9DC50 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
CrotQ9DC50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
CrotQ9DC50 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
CrotQ9DC50 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
CrotQ9DC50 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
CrotQ9DC50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
CrotQ9DC50 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
CrotQ9DC50 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
CrotQ9DC50 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
CrotQ9DC50 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
CrotQ9DC50 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
CrotQ9DC50 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
CrotQ9DC50 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
CrotQ9DC50 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
CrotQ9DC50 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
CrotQ9DC50 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
CrotQ9DC50 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
CrotQ9DC50 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
CrotQ9DC50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
CrotQ9DC50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
CrotQ9DC50 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
CrotQ9DC50 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,38■■□□□ 1,81
CrotQ9DC50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
CrotQ9DC50 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
CrotQ9DC50 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
CrotQ9DC50 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
CrotQ9DC50 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
CrotQ9DC50 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
CrotQ9DC50 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
CrotQ9DC50 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
CrotQ9DC50 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,29■■□□□ 1,8
CrotQ9DC50 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
CrotQ9DC50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
CrotQ9DC50 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
CrotQ9DC50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
CrotQ9DC50 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
CrotQ9DC50 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
CrotQ9DC50 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
CrotQ9DC50 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms