Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrotQ9DC50 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CrotQ9DC50 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CrotQ9DC50 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CrotQ9DC50 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CrotQ9DC50 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CrotQ9DC50 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CrotQ9DC50 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CrotQ9DC50 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrotQ9DC50 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrotQ9DC50 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrotQ9DC50 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrotQ9DC50 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CrotQ9DC50 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrotQ9DC50 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrotQ9DC50 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CrotQ9DC50 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CrotQ9DC50 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrotQ9DC50 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CrotQ9DC50 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CrotQ9DC50 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CrotQ9DC50 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CrotQ9DC50 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CrotQ9DC50 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CrotQ9DC50 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CrotQ9DC50 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CrotQ9DC50 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CrotQ9DC50 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CrotQ9DC50 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrotQ9DC50 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CrotQ9DC50 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CrotQ9DC50 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CrotQ9DC50 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrotQ9DC50 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrotQ9DC50 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrotQ9DC50 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrotQ9DC50 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrotQ9DC50 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CrotQ9DC50 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CrotQ9DC50 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrotQ9DC50 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CrotQ9DC50 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CrotQ9DC50 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CrotQ9DC50 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CrotQ9DC50 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CrotQ9DC50 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CrotQ9DC50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CrotQ9DC50 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrotQ9DC50 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrotQ9DC50 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrotQ9DC50 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrotQ9DC50 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CrotQ9DC50 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrotQ9DC50 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrotQ9DC50 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CrotQ9DC50 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CrotQ9DC50 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CrotQ9DC50 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CrotQ9DC50 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CrotQ9DC50 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CrotQ9DC50 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CrotQ9DC50 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CrotQ9DC50 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CrotQ9DC50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CrotQ9DC50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CrotQ9DC50 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CrotQ9DC50 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CrotQ9DC50 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrotQ9DC50 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CrotQ9DC50 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CrotQ9DC50 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CrotQ9DC50 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CrotQ9DC50 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrotQ9DC50 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CrotQ9DC50 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CrotQ9DC50 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CrotQ9DC50 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CrotQ9DC50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CrotQ9DC50 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CrotQ9DC50 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CrotQ9DC50 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CrotQ9DC50 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CrotQ9DC50 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CrotQ9DC50 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms