Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkar1aQ9DBC7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkar1aQ9DBC7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkar1aQ9DBC7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkar1aQ9DBC7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkar1aQ9DBC7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkar1aQ9DBC7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkar1aQ9DBC7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkar1aQ9DBC7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkar1aQ9DBC7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prkar1aQ9DBC7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkar1aQ9DBC7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkar1aQ9DBC7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkar1aQ9DBC7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkar1aQ9DBC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkar1aQ9DBC7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkar1aQ9DBC7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkar1aQ9DBC7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkar1aQ9DBC7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkar1aQ9DBC7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkar1aQ9DBC7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkar1aQ9DBC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkar1aQ9DBC7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkar1aQ9DBC7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkar1aQ9DBC7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkar1aQ9DBC7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prkar1aQ9DBC7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkar1aQ9DBC7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkar1aQ9DBC7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkar1aQ9DBC7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkar1aQ9DBC7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkar1aQ9DBC7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkar1aQ9DBC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkar1aQ9DBC7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkar1aQ9DBC7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkar1aQ9DBC7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkar1aQ9DBC7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkar1aQ9DBC7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkar1aQ9DBC7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkar1aQ9DBC7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkar1aQ9DBC7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkar1aQ9DBC7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkar1aQ9DBC7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkar1aQ9DBC7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkar1aQ9DBC7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkar1aQ9DBC7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkar1aQ9DBC7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkar1aQ9DBC7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkar1aQ9DBC7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkar1aQ9DBC7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkar1aQ9DBC7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkar1aQ9DBC7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkar1aQ9DBC7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkar1aQ9DBC7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkar1aQ9DBC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkar1aQ9DBC7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkar1aQ9DBC7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkar1aQ9DBC7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkar1aQ9DBC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkar1aQ9DBC7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkar1aQ9DBC7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkar1aQ9DBC7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkar1aQ9DBC7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkar1aQ9DBC7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkar1aQ9DBC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkar1aQ9DBC7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkar1aQ9DBC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms