Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB30

Phkg2, Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, liver/testis isoform, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phkg2Q9DB30 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Phkg2Q9DB30 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Phkg2Q9DB30 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Phkg2Q9DB30 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Phkg2Q9DB30 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Phkg2Q9DB30 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Phkg2Q9DB30 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Phkg2Q9DB30 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Phkg2Q9DB30 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Phkg2Q9DB30 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Phkg2Q9DB30 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Phkg2Q9DB30 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Phkg2Q9DB30 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Phkg2Q9DB30 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Phkg2Q9DB30 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Phkg2Q9DB30 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Phkg2Q9DB30 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Phkg2Q9DB30 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Phkg2Q9DB30 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Phkg2Q9DB30 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Phkg2Q9DB30 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Phkg2Q9DB30 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Phkg2Q9DB30 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Phkg2Q9DB30 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Phkg2Q9DB30 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Phkg2Q9DB30 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Phkg2Q9DB30 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Phkg2Q9DB30 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Phkg2Q9DB30 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Phkg2Q9DB30 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Phkg2Q9DB30 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Phkg2Q9DB30 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Phkg2Q9DB30 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Phkg2Q9DB30 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Phkg2Q9DB30 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Phkg2Q9DB30 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Phkg2Q9DB30 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Phkg2Q9DB30 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Phkg2Q9DB30 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Phkg2Q9DB30 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Phkg2Q9DB30 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Phkg2Q9DB30 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Phkg2Q9DB30 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Phkg2Q9DB30 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Phkg2Q9DB30 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Phkg2Q9DB30 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Phkg2Q9DB30 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Phkg2Q9DB30 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Phkg2Q9DB30 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Phkg2Q9DB30 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Phkg2Q9DB30 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Phkg2Q9DB30 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Phkg2Q9DB30 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Phkg2Q9DB30 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Phkg2Q9DB30 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Phkg2Q9DB30 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Phkg2Q9DB30 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Phkg2Q9DB30 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Phkg2Q9DB30 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Phkg2Q9DB30 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Phkg2Q9DB30 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Phkg2Q9DB30 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Phkg2Q9DB30 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Phkg2Q9DB30 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Phkg2Q9DB30 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Phkg2Q9DB30 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Phkg2Q9DB30 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Phkg2Q9DB30 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Phkg2Q9DB30 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Phkg2Q9DB30 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Phkg2Q9DB30 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Phkg2Q9DB30 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Phkg2Q9DB30 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Phkg2Q9DB30 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Phkg2Q9DB30 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Phkg2Q9DB30 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Phkg2Q9DB30 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Phkg2Q9DB30 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Phkg2Q9DB30 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Phkg2Q9DB30 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Phkg2Q9DB30 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Phkg2Q9DB30 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Phkg2Q9DB30 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Phkg2Q9DB30 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Phkg2Q9DB30 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Phkg2Q9DB30 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Phkg2Q9DB30 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms