Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnn3Q9DAW9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnn3Q9DAW9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnn3Q9DAW9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn3Q9DAW9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnn3Q9DAW9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnn3Q9DAW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnn3Q9DAW9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnn3Q9DAW9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnn3Q9DAW9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnn3Q9DAW9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnn3Q9DAW9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnn3Q9DAW9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnn3Q9DAW9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnn3Q9DAW9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn3Q9DAW9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnn3Q9DAW9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnn3Q9DAW9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnn3Q9DAW9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnn3Q9DAW9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnn3Q9DAW9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn3Q9DAW9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnn3Q9DAW9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnn3Q9DAW9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnn3Q9DAW9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnn3Q9DAW9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnn3Q9DAW9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnn3Q9DAW9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnn3Q9DAW9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnn3Q9DAW9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnn3Q9DAW9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnn3Q9DAW9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnn3Q9DAW9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnn3Q9DAW9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnn3Q9DAW9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnn3Q9DAW9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnn3Q9DAW9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnn3Q9DAW9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnn3Q9DAW9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn3Q9DAW9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnn3Q9DAW9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnn3Q9DAW9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnn3Q9DAW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnn3Q9DAW9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnn3Q9DAW9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnn3Q9DAW9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnn3Q9DAW9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnn3Q9DAW9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn3Q9DAW9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnn3Q9DAW9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnn3Q9DAW9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnn3Q9DAW9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnn3Q9DAW9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnn3Q9DAW9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn3Q9DAW9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnn3Q9DAW9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnn3Q9DAW9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn3Q9DAW9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn3Q9DAW9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnn3Q9DAW9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnn3Q9DAW9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnn3Q9DAW9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnn3Q9DAW9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnn3Q9DAW9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnn3Q9DAW9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnn3Q9DAW9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn3Q9DAW9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnn3Q9DAW9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnn3Q9DAW9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms