Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA19

Cir1, Corepressor interacting with RBPJ 1, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cir1Q9DA19 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cir1Q9DA19 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cir1Q9DA19 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cir1Q9DA19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cir1Q9DA19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cir1Q9DA19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cir1Q9DA19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cir1Q9DA19 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cir1Q9DA19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cir1Q9DA19 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cir1Q9DA19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cir1Q9DA19 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cir1Q9DA19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cir1Q9DA19 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cir1Q9DA19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cir1Q9DA19 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cir1Q9DA19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cir1Q9DA19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cir1Q9DA19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cir1Q9DA19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cir1Q9DA19 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cir1Q9DA19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cir1Q9DA19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cir1Q9DA19 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cir1Q9DA19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cir1Q9DA19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cir1Q9DA19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cir1Q9DA19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cir1Q9DA19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cir1Q9DA19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cir1Q9DA19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cir1Q9DA19 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cir1Q9DA19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cir1Q9DA19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cir1Q9DA19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cir1Q9DA19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cir1Q9DA19 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cir1Q9DA19 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cir1Q9DA19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cir1Q9DA19 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cir1Q9DA19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cir1Q9DA19 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cir1Q9DA19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cir1Q9DA19 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cir1Q9DA19 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cir1Q9DA19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cir1Q9DA19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cir1Q9DA19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cir1Q9DA19 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cir1Q9DA19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cir1Q9DA19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cir1Q9DA19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cir1Q9DA19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cir1Q9DA19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cir1Q9DA19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cir1Q9DA19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cir1Q9DA19 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cir1Q9DA19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms