Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R3

Spata9, Spermatogenesis-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata9Q9D9R3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spata9Q9D9R3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spata9Q9D9R3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spata9Q9D9R3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Spata9Q9D9R3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spata9Q9D9R3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spata9Q9D9R3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Spata9Q9D9R3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spata9Q9D9R3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spata9Q9D9R3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spata9Q9D9R3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spata9Q9D9R3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Spata9Q9D9R3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Spata9Q9D9R3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spata9Q9D9R3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Spata9Q9D9R3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Spata9Q9D9R3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Spata9Q9D9R3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Spata9Q9D9R3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spata9Q9D9R3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Spata9Q9D9R3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spata9Q9D9R3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Spata9Q9D9R3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Spata9Q9D9R3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spata9Q9D9R3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spata9Q9D9R3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spata9Q9D9R3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spata9Q9D9R3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spata9Q9D9R3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spata9Q9D9R3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spata9Q9D9R3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spata9Q9D9R3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spata9Q9D9R3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Spata9Q9D9R3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Spata9Q9D9R3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spata9Q9D9R3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spata9Q9D9R3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spata9Q9D9R3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spata9Q9D9R3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spata9Q9D9R3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spata9Q9D9R3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spata9Q9D9R3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spata9Q9D9R3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spata9Q9D9R3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spata9Q9D9R3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spata9Q9D9R3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Spata9Q9D9R3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spata9Q9D9R3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spata9Q9D9R3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spata9Q9D9R3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spata9Q9D9R3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spata9Q9D9R3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spata9Q9D9R3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Spata9Q9D9R3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spata9Q9D9R3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spata9Q9D9R3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spata9Q9D9R3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spata9Q9D9R3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spata9Q9D9R3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spata9Q9D9R3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spata9Q9D9R3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Spata9Q9D9R3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Spata9Q9D9R3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spata9Q9D9R3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spata9Q9D9R3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Spata9Q9D9R3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Spata9Q9D9R3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spata9Q9D9R3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Spata9Q9D9R3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spata9Q9D9R3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spata9Q9D9R3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spata9Q9D9R3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spata9Q9D9R3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Spata9Q9D9R3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spata9Q9D9R3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spata9Q9D9R3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spata9Q9D9R3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Spata9Q9D9R3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Spata9Q9D9R3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Spata9Q9D9R3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Spata9Q9D9R3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spata9Q9D9R3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spata9Q9D9R3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Spata9Q9D9R3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spata9Q9D9R3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms