Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Llcfc1Q9D9P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Llcfc1Q9D9P8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Llcfc1Q9D9P8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Llcfc1Q9D9P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Llcfc1Q9D9P8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Llcfc1Q9D9P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Llcfc1Q9D9P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Llcfc1Q9D9P8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Llcfc1Q9D9P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Llcfc1Q9D9P8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Llcfc1Q9D9P8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Llcfc1Q9D9P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Llcfc1Q9D9P8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Llcfc1Q9D9P8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Llcfc1Q9D9P8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Llcfc1Q9D9P8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Llcfc1Q9D9P8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Llcfc1Q9D9P8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Llcfc1Q9D9P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Llcfc1Q9D9P8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Llcfc1Q9D9P8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Llcfc1Q9D9P8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Llcfc1Q9D9P8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Llcfc1Q9D9P8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Llcfc1Q9D9P8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Llcfc1Q9D9P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Llcfc1Q9D9P8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Llcfc1Q9D9P8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Llcfc1Q9D9P8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Llcfc1Q9D9P8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Llcfc1Q9D9P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Llcfc1Q9D9P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Llcfc1Q9D9P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Llcfc1Q9D9P8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Llcfc1Q9D9P8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Llcfc1Q9D9P8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Llcfc1Q9D9P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Llcfc1Q9D9P8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Llcfc1Q9D9P8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Llcfc1Q9D9P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Llcfc1Q9D9P8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Llcfc1Q9D9P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Llcfc1Q9D9P8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Llcfc1Q9D9P8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms