Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajc4Q9D844 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc4Q9D844 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajc4Q9D844 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajc4Q9D844 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnajc4Q9D844 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc4Q9D844 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc4Q9D844 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc4Q9D844 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc4Q9D844 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc4Q9D844 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc4Q9D844 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc4Q9D844 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc4Q9D844 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc4Q9D844 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc4Q9D844 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc4Q9D844 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc4Q9D844 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc4Q9D844 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc4Q9D844 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc4Q9D844 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc4Q9D844 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc4Q9D844 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnajc4Q9D844 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc4Q9D844 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnajc4Q9D844 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnajc4Q9D844 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnajc4Q9D844 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc4Q9D844 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc4Q9D844 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnajc4Q9D844 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc4Q9D844 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnajc4Q9D844 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc4Q9D844 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnajc4Q9D844 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc4Q9D844 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc4Q9D844 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc4Q9D844 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc4Q9D844 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc4Q9D844 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc4Q9D844 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc4Q9D844 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc4Q9D844 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc4Q9D844 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc4Q9D844 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc4Q9D844 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc4Q9D844 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc4Q9D844 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnajc4Q9D844 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnajc4Q9D844 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc4Q9D844 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc4Q9D844 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc4Q9D844 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc4Q9D844 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc4Q9D844 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc4Q9D844 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc4Q9D844 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc4Q9D844 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc4Q9D844 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc4Q9D844 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc4Q9D844 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc4Q9D844 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc4Q9D844 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc4Q9D844 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc4Q9D844 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc4Q9D844 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms