Protein–RNA interactions for Protein: Q9D552

Spata17, Spermatogenesis-associated protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata17Q9D552 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Spata17Q9D552 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Spata17Q9D552 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Spata17Q9D552 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Spata17Q9D552 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Spata17Q9D552 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spata17Q9D552 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Spata17Q9D552 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Spata17Q9D552 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Spata17Q9D552 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Spata17Q9D552 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Spata17Q9D552 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Spata17Q9D552 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spata17Q9D552 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spata17Q9D552 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Spata17Q9D552 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Spata17Q9D552 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Spata17Q9D552 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Spata17Q9D552 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Spata17Q9D552 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Spata17Q9D552 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Spata17Q9D552 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Spata17Q9D552 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Spata17Q9D552 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Spata17Q9D552 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Spata17Q9D552 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spata17Q9D552 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Spata17Q9D552 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spata17Q9D552 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Spata17Q9D552 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spata17Q9D552 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Spata17Q9D552 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Spata17Q9D552 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spata17Q9D552 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spata17Q9D552 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spata17Q9D552 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spata17Q9D552 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spata17Q9D552 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spata17Q9D552 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spata17Q9D552 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Spata17Q9D552 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Spata17Q9D552 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spata17Q9D552 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spata17Q9D552 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spata17Q9D552 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spata17Q9D552 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spata17Q9D552 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spata17Q9D552 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spata17Q9D552 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spata17Q9D552 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spata17Q9D552 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spata17Q9D552 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spata17Q9D552 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spata17Q9D552 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spata17Q9D552 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Spata17Q9D552 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Spata17Q9D552 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spata17Q9D552 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spata17Q9D552 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Spata17Q9D552 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Spata17Q9D552 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Spata17Q9D552 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Spata17Q9D552 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Spata17Q9D552 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spata17Q9D552 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spata17Q9D552 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spata17Q9D552 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Spata17Q9D552 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Spata17Q9D552 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Spata17Q9D552 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Spata17Q9D552 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spata17Q9D552 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spata17Q9D552 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spata17Q9D552 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spata17Q9D552 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Spata17Q9D552 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Spata17Q9D552 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Spata17Q9D552 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spata17Q9D552 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spata17Q9D552 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spata17Q9D552 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Spata17Q9D552 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Spata17Q9D552 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Spata17Q9D552 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms