Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Odf2lQ9D478 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Odf2lQ9D478 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Odf2lQ9D478 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Odf2lQ9D478 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,7■■■□□ 2,83
Odf2lQ9D478 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Odf2lQ9D478 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,66■■■□□ 2,82
Odf2lQ9D478 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Odf2lQ9D478 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Odf2lQ9D478 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Odf2lQ9D478 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Odf2lQ9D478 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Odf2lQ9D478 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Odf2lQ9D478 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Odf2lQ9D478 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Odf2lQ9D478 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Odf2lQ9D478 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Odf2lQ9D478 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Odf2lQ9D478 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Odf2lQ9D478 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Odf2lQ9D478 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Odf2lQ9D478 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Odf2lQ9D478 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Odf2lQ9D478 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Odf2lQ9D478 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Odf2lQ9D478 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Odf2lQ9D478 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Odf2lQ9D478 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Odf2lQ9D478 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Odf2lQ9D478 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Odf2lQ9D478 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
Odf2lQ9D478 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
Odf2lQ9D478 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Odf2lQ9D478 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Odf2lQ9D478 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,02■■■□□ 2,72
Odf2lQ9D478 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Odf2lQ9D478 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Odf2lQ9D478 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Odf2lQ9D478 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Odf2lQ9D478 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Odf2lQ9D478 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Odf2lQ9D478 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Odf2lQ9D478 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Odf2lQ9D478 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Odf2lQ9D478 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Odf2lQ9D478 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Odf2lQ9D478 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Odf2lQ9D478 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Odf2lQ9D478 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Odf2lQ9D478 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Odf2lQ9D478 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Odf2lQ9D478 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Odf2lQ9D478 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Odf2lQ9D478 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Odf2lQ9D478 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Odf2lQ9D478 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Odf2lQ9D478 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Odf2lQ9D478 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Odf2lQ9D478 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Odf2lQ9D478 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Odf2lQ9D478 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Odf2lQ9D478 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Odf2lQ9D478 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Odf2lQ9D478 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Odf2lQ9D478 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Odf2lQ9D478 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Odf2lQ9D478 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Odf2lQ9D478 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Odf2lQ9D478 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Odf2lQ9D478 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Odf2lQ9D478 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Odf2lQ9D478 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Odf2lQ9D478 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Odf2lQ9D478 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Odf2lQ9D478 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Odf2lQ9D478 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Odf2lQ9D478 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Odf2lQ9D478 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Odf2lQ9D478 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Odf2lQ9D478 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Odf2lQ9D478 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Odf2lQ9D478 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Odf2lQ9D478 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Odf2lQ9D478 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Odf2lQ9D478 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Odf2lQ9D478 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Odf2lQ9D478 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Odf2lQ9D478 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6,5 ms