Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a4cQ9D3F6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a4cQ9D3F6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a4cQ9D3F6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a4cQ9D3F6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a4cQ9D3F6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a4cQ9D3F6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a4cQ9D3F6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a4cQ9D3F6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a4cQ9D3F6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a4cQ9D3F6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a4cQ9D3F6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a4cQ9D3F6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a4cQ9D3F6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a4cQ9D3F6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a4cQ9D3F6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a4cQ9D3F6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a4cQ9D3F6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a4cQ9D3F6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a4cQ9D3F6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a4cQ9D3F6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a4cQ9D3F6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a4cQ9D3F6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a4cQ9D3F6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a4cQ9D3F6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4cQ9D3F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4cQ9D3F6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a4cQ9D3F6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a4cQ9D3F6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a4cQ9D3F6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a4cQ9D3F6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4cQ9D3F6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a4cQ9D3F6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a4cQ9D3F6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a4cQ9D3F6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a4cQ9D3F6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a4cQ9D3F6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a4cQ9D3F6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a4cQ9D3F6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ms4a4cQ9D3F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ms4a4cQ9D3F6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ms4a4cQ9D3F6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ms4a4cQ9D3F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ms4a4cQ9D3F6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a4cQ9D3F6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms